RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554698.5

SDR39U1-208, Transcript of short chain dehydrogenase/reductase family 39U member 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene SDR39U1, Length 1,364 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SDR39U1-208	ENST00000554698	GJA8	P48165	433 aa		24.51	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	TRIM29	Q14134	588 aa		24.51	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRT40	Q6A162	431 aa		24.51	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		24.51	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	24.51	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		24.51	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		24.51	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	MCM3AP	O60318	1980 aa		24.51	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	ADCY6	O43306	1168 aa		24.5	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	SGPL1	O95470	568 aa		24.5	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	MMP1	P03956	469 aa		24.5	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		24.5	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	HSCB	Q8IWL3	235 aa		24.5	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	SCFD2	Q8WU76	684 aa		24.5	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	C8orf76	Q96K31	380 aa		24.5	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	24.5	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	24.49	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	POTEF	A5A3E0	1075 aa		24.49	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	24.49	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		24.49	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	KIF3A	Q9Y496	699 aa		24.49	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	24.48	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	RARB	P10826	455 aa		24.48	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	SMPD1	P17405	629 aa		24.48	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	CAPN2	P17655	700 aa		24.48	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	GJB2	P29033	226 aa		24.48	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	FOSB	P53539	338 aa		24.48	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	ARHGAP4	P98171	946 aa		24.48	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	TNFAIP2	Q03169	654 aa		24.48	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		24.48	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		24.48	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		24.48	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	OXER1	Q8TDS5	423 aa		24.48	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	24.48	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	24.48	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		24.48	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		24.48	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	24.48	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	CYP3A4	P08684	503 aa		24.47	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		24.47	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		24.47	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	ANO1	Q5XXA6	986 aa		24.47	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		24.47	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	ARIH2	O95376	493 aa		24.46	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	ITGB5	P18084	799 aa		24.46	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRT2	P35908	639 aa		24.46	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	TTLL4	Q14679	1199 aa		24.46	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		24.46	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		24.46	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	TNFRSF25	Q93038	417 aa		24.46	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		24.46	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		24.46	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	BRCA2	P51587	3418 aa		24.45	■■□□□ 1.51
SDR39U1-208	ENST00000554698	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	24.45	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	ICAM3	P32942	547 aa		24.45	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	24.45	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		24.45	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698		Q9Y3F1	56 aa		24.45	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		24.44	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	24.44	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	24.44	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	TGFB3	P10600	412 aa		24.44	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	SOX10	P56693	466 aa		24.44	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	GUCY1B3	Q02153	619 aa		24.44	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	NR5A1	Q13285	461 aa		24.44	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		24.44	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	GPRASP2	Q96D09	838 aa		24.44	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	24.44	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	24.44	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		24.44	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	24.44	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		24.44	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	BTBD18	B2RXH4	712 aa		24.43	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	FIBP	O43427	364 aa		24.43	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	EDIL3	O43854	480 aa		24.43	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	ADAMTS4	O75173	837 aa		24.43	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	24.43	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	NKX3-2	P78367	333 aa		24.43	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	SEMA3F	Q13275	785 aa		24.43	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	24.43	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	24.43	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	CEP55	Q53EZ4	464 aa		24.43	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	24.43	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	NLRX1	Q86UT6	975 aa		24.43	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	TBCK	Q8TEA7	893 aa		24.43	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		24.43	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	JADE2	Q9NQC1	790 aa		24.43	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		24.42	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	PGK1	P00558	417 aa		24.42	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	PTGS1	P23219	599 aa		24.42	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	CIITA	P33076	1130 aa		24.42	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	USP11	P51784	963 aa		24.42	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	GJA9	P57773	515 aa		24.42	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	LY6K	Q17RY6	165 aa		24.42	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		24.42	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	TLK2	Q86UE8	772 aa		24.42	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		24.42	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	FAM86B1	E9PN63	330 aa		24.42	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	MEIS1	O00470	390 aa		24.42	■■□□□ 1.5
SDR39U1-208	ENST00000554698	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		24.42	■■□□□ 1.5

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