RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528478.1

SBF2-208, Transcript of SET binding factor 2, human

TSL 4

Gene SBF2, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SBF2-208	ENST00000528478	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	MAP3K11	Q16584	847 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	MOB2	Q70IA6	237 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	MFSD3	Q96ES6	412 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	CDCA5	Q96FF9	252 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	RHOV	Q96L33	236 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	MXD3	Q9BW11	206 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	RNF186	Q9NXI6	227 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	UBP1	Q9NZI7	540 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	SAMM50	Q9Y512	469 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	USP3	Q9Y6I4	520 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SBF2-208	ENST00000528478	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	PSME4	Q14997	1843 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	PDE8A	O60658	829 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	DDAH1	O94760	285 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	GIPR	P48546	466 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	RGS19	P49795	217 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	SOX10	P56693	466 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	NFKB2	Q00653	900 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	SEZ6	Q53EL9	994 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	NLRP8	Q86W28	1048 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TSPYL6	Q8N831	410 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	PHC3	Q8NDX5	983 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	SUSD3	Q96L08	255 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	APBA2	Q99767	749 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478		F6X3S4	739 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	IGKV5-2	P06315	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ELN	P15502	786 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	KLRK1	P26718	216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	GNAL	P38405	381 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	PLA2G4A	P47712	749 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	GNAI1	P63096	354 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	PPP2R5E	Q16537	467 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	G2E3	Q7L622	706 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	ELOA3	Q8NG57	546 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	GREM2	Q9H772	168 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	PPT2	Q9UMR5	302 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	XDH	P47989	1333 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	MYH3	P11055	1940 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SBF2-208	ENST00000528478		M0R082	166 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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