RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM196BA6NMK8 535 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAN2A1Q16706 1144 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM133AQ8N9E0 248 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CNKSR1Q969H4 720 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCC12Q96J65 1359 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCNE1P24864 410 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CUL4BQ13620 913 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MIGA2Q7L4E1 593 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAOK1Q7L7X3 1001 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MINPP1Q9UNW1 487 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MTMR3Q13615 1198 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC144BQ3MJ40 725 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SEPT12Q8IYM1 358 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRPC6Q9Y210 931 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADCY8P40145 1251 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAF12Q16514 161 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMTC3Q6ZXV5 915 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC89Q8N998 374 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPS6KA4O75676 772 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF131P52739 623 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDAN1Q8IWY9 1227 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF577Q9BSK1 485 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL25Q9H293 177 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PXDNLA1KZ92 1463 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCCP43146 1447 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC14Q49A88 953 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCYL2Q6P3W7 929 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM49BA6NDI0 452 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRT27Q7Z3Y8 459 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM186BQ8IYM0 893 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDUFA10O95299 355 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BMP3P12645 472 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAGEF1Q9HAY2 307 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GEN1Q17RS7 908 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PARD6BQ9BYG5 372 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DISC1Q9NRI5 854 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EMILIN3Q9NT22 766 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RWDD2AQ9UIY3 292 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYOM1P52179 1685 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOXN1O15353 648 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KAZNQ674X7 775 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CSADQ9Y600 493 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SFI1A8K8P3 1242 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MOCS3O95396 460 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RESP18Q5W5W9 173 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DGKHQ86XP1 1220 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STAG1Q8WVM7 1258 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTPN22Q9Y2R2 807 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAF6LQ9Y6J9 622 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NAA25Q14CX7 972 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GOLGA5Q8TBA6 731 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPB41L5Q9HCM4 733 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POTEMA6NI47 508 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMOD1P28289 359 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MCTP2Q6DN12 878 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LY9Q9HBG7 655 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDE6CP51160 858 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 YARSP54577 528 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAP7D1Q3KQU3 841 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HOOK2Q96ED9 719 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MMS19Q96T76 1030 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BHMT2Q9H2M3 363 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDST4Q9H3R1 872 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A6NNZ2 444 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GFPT2O94808 682 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STX2P32856 288 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLCN6P51797 869 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGBP1P78318 339 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZBED6P86452 979 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOXO4P98177 505 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRAPQ13588 217 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TUBB8Q3ZCM7 444 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa18.12■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FYB2Q5VWT5 728 aa18.11■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPM1EQ8WY54 764 aa18.11■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM47Q9BQJ4 181 aa18.11■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYO5BQ9ULV0 1848 aa18.11■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GSG1L2A8MUP6 293 aa18.11■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C2orf54Q08AI8 447 aa18.11■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STMN2Q93045 179 aa18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms