RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 NAT2P11245 290 aa7.4□□□□□ -1.22
STRADBP1-201ENST00000478954 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
STRADBP1-201ENST00000478954 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.4□□□□□ -1.22
STRADBP1-201ENST00000478954 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.4□□□□□ -1.22
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC6A19Q695T7 634 aa7.4□□□□□ -1.22
STRADBP1-201ENST00000478954 OGFOD3Q6PK18 319 aa7.4□□□□□ -1.22
STRADBP1-201ENST00000478954 NSMFQ6X4W1 530 aa7.4□□□□□ -1.22
STRADBP1-201ENST00000478954 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
STRADBP1-201ENST00000478954 FGD2Q7Z6J4 655 aa7.4□□□□□ -1.22
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC51AQ86UW1 340 aa7.4□□□□□ -1.22
STRADBP1-201ENST00000478954 HID1Q8IV36 788 aa7.4□□□□□ -1.22
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STRADBP1-201ENST00000478954 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
STRADBP1-201ENST00000478954 MTFR1LQ9H019 292 aa7.4□□□□□ -1.22
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF112Q9ULX5 631 aa7.4□□□□□ -1.22
STRADBP1-201ENST00000478954 USP32Q8NFA0 1604 aa7.4□□□□□ -1.22
STRADBP1-201ENST00000478954 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
STRADBP1-201ENST00000478954 CROCC2H7BZ55 1655 aa7.4□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa7.39□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 C1orf167Q5SNV9 1468 aa7.39□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 NOS1P29475 1434 aa7.39□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa7.39□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 ATP10DQ9P241 1426 aa7.39□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 SHTN1A0MZ66 631 aa7.39□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 SLITRK5O94991 958 aa7.39□□□□□ -1.23
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STRADBP1-201ENST00000478954 PPP2R5AQ15172 486 aa7.39□□□□□ -1.23
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STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC136Q96JN2 1154 aa7.39□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 FOXQ1Q9C009 403 aa7.39□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC52A2Q9HAB3 445 aa7.39□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.39□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 ATG3Q9NT62 314 aa7.39□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa7.39□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa7.39□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 PIK3R4Q99570 1358 aa7.38□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa7.38□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 CLEC3AO75596 197 aa7.38□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 LRIG2O94898 1065 aa7.38□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 RASGRP1O95267 797 aa7.38□□□□□ -1.23
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STRADBP1-201ENST00000478954 GNALP38405 381 aa7.38□□□□□ -1.23
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STRADBP1-201ENST00000478954 RHBDL3P58872 404 aa7.38□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF460Q14592 562 aa7.38□□□□□ -1.23
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STRADBP1-201ENST00000478954 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.38□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 BRAPQ7Z569 592 aa7.38□□□□□ -1.23
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STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 PIM2Q9P1W9 311 aa7.38□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 NDOR1Q9UHB4 597 aa7.38□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 NRAPQ86VF7 1730 aa7.38□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa7.38□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 BLACEA4D250 179 aa7.37□□□□□ -1.23
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STRADBP1-201ENST00000478954 DLX3O60479 287 aa7.37□□□□□ -1.23
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STRADBP1-201ENST00000478954 SCGB1D2O95969 90 aa7.37□□□□□ -1.23
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STRADBP1-201ENST00000478954 SSTR4P31391 388 aa7.37□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa7.37□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 PPM1KQ8N3J5 372 aa7.37□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.37□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 BVESQ8NE79 360 aa7.37□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.37□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 WDR66Q8TBY9 1149 aa7.37□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 MORC4Q8TE76 937 aa7.37□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 SCLYQ96I15 445 aa7.37□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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STRADBP1-201ENST00000478954 TRIM8Q9BZR9 551 aa7.37□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.37□□□□□ -1.23
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STRADBP1-201ENST00000478954 GCC2Q8IWJ2 1684 aa7.37□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC18Q5T9S5 1454 aa7.36□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC141Q6ZP82 1450 aa7.36□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 MTUS2Q5JR59 1369 aa7.36□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 NEK2P51955 445 aa7.36□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 STAT4Q14765 748 aa7.36□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR162Q16538 588 aa7.36□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa7.36□□□□□ -1.23
STRADBP1-201ENST00000478954 RELTQ969Z4 430 aa7.36□□□□□ -1.23
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