RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 ANO3Q9BYT9 981 aa20.04■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.04■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 BANK1Q8NDB2 785 aa20.04■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 GMCL1Q96IK5 515 aa20.04■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa20.03■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa20.03■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 TXLNAP40222 546 aa20.03■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 UBASH3AP57075 661 aa20.03■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 MCM6Q14566 821 aa20.03■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 CNPY4Q8N129 248 aa20.03■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 WNK4Q96J92 1243 aa20.03■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 FAM86B1E9PN63 330 aa20.03■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 FZD9O00144 591 aa20.03■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.03■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 SARM1Q6SZW1 724 aa20.03■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 FCER1AP12319 257 aa20.02■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 JRKLQ9Y4A0 524 aa20.02■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.02■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 CLCN6P51797 869 aa20.02■□□□□ 0.8
PDE4D-204ENST00000358923 BRCA2P51587 3418 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 GRB10Q13322 594 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 MTMR2Q13614 643 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 KANK3Q6NY19 840 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 FAM83AQ86UY5 434 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 BPIFA3Q9BQP9 254 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 PSME4Q14997 1843 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 PRCPP42785 496 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 DRC1Q96MC2 740 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 VCPKMTQ9H867 229 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 USP27XA6NNY8 438 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 MEIS1O00470 390 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 TEX33O43247 280 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 SPP2Q13103 211 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 SRLQ86TD4 932 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 PNMA5Q96PV4 448 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 GGA3Q9NZ52 723 aa20.01■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 ARHGAP4P98171 946 aa20■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa20■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 IGSF22Q8N9C0 903 aa20■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 BCAS3Q9H6U6 928 aa20■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 GOPCQ9HD26 462 aa20■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa19.99■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 IKBKBO14920 756 aa19.99■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 ARMCX5Q6P1M9 558 aa19.99■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 MLKLQ8NB16 471 aa19.99■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 TANGO6Q9C0B7 1094 aa19.99■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 LRRC8AQ8IWT6 810 aa19.99■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa19.99■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 PCDHA12Q9UN75 941 aa19.99■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 ASIC1P78348 528 aa19.98■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 CYP4A11Q02928 519 aa19.98■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 STK4Q13043 487 aa19.98■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 WRNIP1Q96S55 665 aa19.98■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 TBC1D7Q9P0N9 293 aa19.98■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 CEP83Q9Y592 693 aa19.98■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 POTEB3A0JP26 581 aa19.98■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 POTECB2RU33 542 aa19.98■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 E9PMD0 336 aa19.98■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 KLRC4O43908 158 aa19.98■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 ASNSP08243 561 aa19.98■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 POTEBQ6S5H4 581 aa19.98■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 NYAP1Q6ZVC0 841 aa19.98■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 GSDMAQ96QA5 445 aa19.98■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa19.98■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 SPDYE3A6NKU9 549 aa19.98■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 CHMP2AO43633 222 aa19.98■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa19.98■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 CCSER1Q9C0I3 900 aa19.98■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 SLC39A2Q9NP94 309 aa19.98■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 NFIBO00712 420 aa19.97■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 IDEP14735 1019 aa19.97■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 PRPHP41219 470 aa19.97■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 LRRC41Q15345 812 aa19.97■□□□□ 0.79
PDE4D-204ENST00000358923 TMCO3Q6UWJ1 677 aa19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms