RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 LPAR1Q92633 364 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 GGA3Q9NZ52 723 aa20.06■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 ZNF76P36508 570 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 CCZ1BP86790 482 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 EXOC1Q9NV70 894 aa20.05■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 MSH4O15457 936 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 ICAM1P05362 532 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 UBXN2AP68543 259 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 SPP2Q13103 211 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 DYMQ7RTS9 669 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 WRNIP1Q96S55 665 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 CCPG1Q9ULG6 757 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 TBX3O15119 743 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 FCER1AP12319 257 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 SKILP12757 684 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 STK4Q13043 487 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 SEMA3FQ13275 785 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 NR1I3Q14994 352 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 HYIQ5T013 277 aa20.04■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
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ACTB-201ENST00000331789 A0A1B0GTH6 734 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 VCAM1P19320 739 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 HOOK2Q96ED9 719 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 E9PMD0 336 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 MED24O75448 989 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 DDNO94850 711 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 PTPRAP18433 802 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 TEX2Q8IWB9 1127 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 CPXCR1Q8N123 301 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 CCDC150Q8NCX0 1101 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 FAM20AQ96MK3 541 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-201ENST00000331789 POTEB3A0JP26 581 aa20.02■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 POTECB2RU33 542 aa20.02■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 TEX33O43247 280 aa20.02■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 FLOT1O75955 427 aa20.02■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 GOLGA8FQ08AF8 430 aa20.02■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa20.02■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 STIM1Q13586 685 aa20.02■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 POTEBQ6S5H4 581 aa20.02■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 WDR18Q9BV38 432 aa20.02■□□□□ 0.79
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ACTB-201ENST00000331789 USP14P54578 494 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 UNC13DQ70J99 1090 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 CLEC4DQ8WXI8 215 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 DDX12PQ92771 950 aa20.01■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 PARP14Q460N5 1801 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 PSMA7O14818 248 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 BACE1P56817 501 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 SLC39A2Q9NP94 309 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 SSC5DA1L4H1 1573 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 NFIBO00712 420 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20■□□□□ 0.79
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ACTB-201ENST00000331789 HSD17B4P51659 736 aa20■□□□□ 0.79
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ACTB-201ENST00000331789 KRT31Q15323 416 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 DLK2Q6UY11 383 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 SLC30A10Q6XR72 485 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 ZNF280CQ8ND82 737 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 LRRC27Q9C0I9 530 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 AS3MTQ9HBK9 375 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 RNF181Q9P0P0 153 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 VAV3Q9UKW4 847 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 KCNJ18B7U540 433 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 SLC26A4O43511 780 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 IDEP14735 1019 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 KCNJ12Q14500 433 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
ACTB-201ENST00000331789 CATSPER3Q86XQ3 398 aa19.99■□□□□ 0.79
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