RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	CA3	P07451	260 aa		14.04	□□□□□ -0.16
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		14.04	□□□□□ -0.16
TTLL3-233	ENST00000602338	PDE4D	Q08499	809 aa		14.04	□□□□□ -0.16
TTLL3-233	ENST00000602338	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		14.04	□□□□□ -0.16
TTLL3-233	ENST00000602338	CRBN	Q96SW2	442 aa		14.04	□□□□□ -0.16
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		14.04	□□□□□ -0.16
TTLL3-233	ENST00000602338	RFXAP	O00287	272 aa		14.03	□□□□□ -0.16
TTLL3-233	ENST00000602338	PFKM	P08237	780 aa		14.03	□□□□□ -0.16
TTLL3-233	ENST00000602338	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		14.03	□□□□□ -0.16
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	14.03	□□□□□ -0.16
TTLL3-233	ENST00000602338	TFF2	Q03403	129 aa		14.03	□□□□□ -0.16
TTLL3-233	ENST00000602338	USH1G	Q495M9	461 aa		14.03	□□□□□ -0.16
TTLL3-233	ENST00000602338	SCFD2	Q8WU76	684 aa		14.03	□□□□□ -0.16
TTLL3-233	ENST00000602338	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	14.03	□□□□□ -0.16
TTLL3-233	ENST00000602338	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		14.03	□□□□□ -0.16
TTLL3-233	ENST00000602338	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		14.03	□□□□□ -0.16
TTLL3-233	ENST00000602338	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		14.03	□□□□□ -0.16
TTLL3-233	ENST00000602338	RAD50	Q92878	1312 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	PITPNM1	O00562	1244 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	IQCF3	P0C7M6	154 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	SPRED2	Q7Z698	418 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	DNER	Q8NFT8	737 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	TBC1D5	Q92609	795 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	CERS4	Q9HA82	394 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	COL20A1	Q9P218	1284 aa		14.02	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	KRT40	Q6A162	431 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	TTC14	Q96N46	770 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	LNPK	Q9C0E8	428 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		14.01	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	MMP3	P08254	477 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	COL9A1	P20849	921 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	RFC2	P35250	354 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNQ1	P51787	676 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	CHMP4BP1	P59074	171 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	TAP1	Q03518	808 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP1	Q07960	439 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	GPNMB	Q14956	572 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	AFG1L	Q8WV93	481 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	KAT2B	Q92831	832 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC9A7	Q96T83	725 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	PNMA2	Q9UL42	364 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		14	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	KPNA6	O60684	536 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	ACTN1	P12814	892 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	BMP1	P13497	986 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	LY6K	Q17RY6	165 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	PNMA1	Q8ND90	353 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	RGS22	Q8NE09	1264 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	ESR2	Q92731	530 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	SI	P14410	1827 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	LCHN	A4D1U4	455 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	KDM4A	O75164	1064 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	PTGIS	Q16647	500 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	TCTN1	Q2MV58	587 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	DGKH	Q86XP1	1220 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	TICAM2	Q86XR7	235 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	RETREG2	Q8NC44	543 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	RILPL2	Q969X0	211 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	NOD1	Q9Y239	953 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	ABCB11	O95342	1321 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338		B4E1Z4	1266 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	OPLAH	O14841	1288 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	LPXN	O60711	386 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	GH1	P01241	217 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	SDS	P20132	328 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	BFSP2	Q13515	415 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-233	ENST00000602338	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17

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