RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 MAD2L2Q9UI95 211 aa7.59□□□□□ -1.19
RAPGEF6-211ENST00000512611 PAPPAQ13219 1627 aa7.59□□□□□ -1.19
RAPGEF6-211ENST00000512611 ANO9A1A5B4 782 aa7.59□□□□□ -1.19
RAPGEF6-211ENST00000512611 BMP15O95972 392 aa7.59□□□□□ -1.19
RAPGEF6-211ENST00000512611 FGRP09769 529 aa7.59□□□□□ -1.19
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCNE1P24864 410 aa7.59□□□□□ -1.19
RAPGEF6-211ENST00000512611 LSP1P33241 339 aa7.59□□□□□ -1.19
RAPGEF6-211ENST00000512611 HGSNATQ68CP4 663 aa7.59□□□□□ -1.19
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RAPGEF6-211ENST00000512611 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
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RAPGEF6-211ENST00000512611 NUP98P52948 1817 aa7.58□□□□□ -1.2
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RAPGEF6-211ENST00000512611 C8orf74Q6P047 294 aa7.58□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 POTEDQ86YR6 584 aa7.58□□□□□ -1.2
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RAPGEF6-211ENST00000512611 NEUROG2Q9H2A3 272 aa7.58□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
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RAPGEF6-211ENST00000512611 TXKP42681 527 aa7.58□□□□□ -1.2
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RAPGEF6-211ENST00000512611 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 BICDL1Q6ZP65 573 aa7.58□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 PNMA1Q8ND90 353 aa7.58□□□□□ -1.2
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RAPGEF6-211ENST00000512611 MCM9Q9NXL9 1143 aa7.58□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 STXBP3O00186 592 aa7.57□□□□□ -1.2
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RAPGEF6-211ENST00000512611 IFT88Q13099 833 aa7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 PPP2R5BQ15173 497 aa7.57□□□□□ -1.2
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RAPGEF6-211ENST00000512611 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 NCAPGQ9BPX3 1015 aa7.57□□□□□ -1.2
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RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 SHTN1A0MZ66 631 aa7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 POTEMA6NI47 508 aa7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 GOLGA8KD6RF30 607 aa7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 RAD51CO43502 376 aa7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 HSF2BPO75031 334 aa7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 ERFEQ4G0M1 354 aa7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCT8L2Q96SF2 557 aa7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 BRIP1Q9BX63 1249 aa7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 STX8Q9UNK0 236 aa7.57□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 HYOU1Q9Y4L1 999 aa7.57□□□□□ -1.2
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