RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 ANO7Q6IWH7 933 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC89Q8N998 374 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 BRSK1Q8TDC3 778 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 PANK1Q8TE04 598 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 IFT43Q96FT9 208 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 EPN3Q9H201 632 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF521Q96K83 1311 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 GOLGA8KD6RF30 607 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 HAT1O14929 419 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 GHRP10912 638 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 GLULP15104 373 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 PSMA3P25788 255 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SCTRP47872 440 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 HDGFP51858 240 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 NDUFA5Q16718 116 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ARL13BQ3SXY8 428 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CEP78Q5JTW2 689 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 C6orf183Q5T699 404 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 NEK5Q6P3R8 708 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 RASEFQ8IZ41 740 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 PTPRN2Q92932 1015 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 AZIN2Q96A70 460 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TBC1D20Q96BZ9 403 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM87BQ96K49 555 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SYT15Q9BQS2 421 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CEP44Q9C0F1 390 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 EHD4Q9H223 541 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SYNJ1O43426 1573 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 NPATQ14207 1427 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CLASP1Q7Z460 1538 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 A6NJR5 290 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 RASA4BC9J798 803 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 LGR5O75473 907 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 GLI1P08151 1106 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 GBE1Q04446 702 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 LSAMPQ13449 338 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TUBB2AQ13885 445 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ALS2CLQ60I27 953 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 PPFIBP2Q8ND30 876 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SUGCTQ9HAC7 445 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 HPCAL4Q9UM19 191 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 BAG3O95817 575 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 GNAI3P08754 354 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TMED10P49755 219 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SNX16P57768 344 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 KRT83P78385 493 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 PTPROQ16827 1216 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ANO6Q4KMQ2 910 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 RNF220Q5VTB9 566 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CYP26C1Q6V0L0 522 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 RASGRP2Q7LDG7 609 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ITPKCQ96DU7 683 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 HGH1Q9BTY7 390 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SCOCQ9UIL1 159 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 GIT1Q9Y2X7 761 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CFAP73A6NFT4 308 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 CCDC169A6NNP5 214 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 TSPAN9O75954 239 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 UPP2O95045 317 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ITGA2BP08514 1039 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 ALADP13716 330 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 PCK1P35558 622 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 BLVRAP53004 296 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 HPCAP84074 193 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 KIF22Q14807 665 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 NR1D2Q14995 579 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-216ENST00000507116 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
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