RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	PWP1	Q13610	501 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	RASIP1	Q5U651	963 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBXO11	Q86XK2	927 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	SULF2	Q8IWU5	870 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHC3	Q8NDX5	983 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	HAUS7	Q99871	368 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPON1	Q9HCB6	807 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	COL4A5	P29400	1685 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		7.46	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLX4	Q8IY92	1834 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYH3	P11055	1940 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	DLL1	O00548	723 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	GART	P22102	1010 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHML	P26374	656 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	POLD1	P28340	1107 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDC25B	P30305	580 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	ALDH1B1	P30837	517 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARL4D	P49703	201 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	TGFB2	P61812	414 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	AP3B2	Q13367	1082 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF394	Q53GI3	561 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	USP48	Q86UV5	1035 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTLL6	Q8N841	843 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM74	Q96NL1	305 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	XDH	P47989	1333 aa		7.45	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1B0GUL6	1792 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	PIK3R2	O00459	728 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	FOXP2	O15409	715 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADAM11	O75078	769 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	UFL1	O94874	794 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC5A1	P13866	664 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARNT	P27540	789 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM227B	Q96M60	508 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	MXD3	Q9BW11	206 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLVAP	Q9BX97	442 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD209	Q9NNX6	404 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	JAG2	Q9Y219	1238 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	SAMM50	Q9Y512	469 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		7.44	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0D9SFI3	127 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	YDJC	A8MPS7	323 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	GOLIM4	O00461	696 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	CTSB	P07858	339 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL1R1	P14778	569 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	7.43	□□□□□ -1.22	5e-13	■□□□□ 9
RABGGTB-212	ENST00000491266	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	GSTM4	Q03013	218 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	LMNB2	Q03252	620 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	RELL1	Q8IUW5	271 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	CERS5	Q8N5B7	392 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	SYT17	Q9BSW7	474 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	PIM2	Q9P1W9	311 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPEF2	Q9C093	1822 aa		7.43	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	RASSF7	Q02833	373 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP3K11	Q16584	847 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	AOC3	Q16853	763 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		7.42	□□□□□ -1.22
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22

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