RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490639.5

CP-212, Transcript of ceruloplasmin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CP, Length 3,105 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CP-212ENST00000490639 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.21□□□□□ -1.42
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CP-212ENST00000490639 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 USP6NLQ92738 828 aa6.21□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 C6orf50Q9HD87 102 aa6.21□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 FBXO40Q9UH90 709 aa6.21□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 PNMA2Q9UL42 364 aa6.21□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.2□□□□□ -1.42
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CP-212ENST00000490639 POLR2MP0CAP2 368 aa6.2□□□□□ -1.42
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CP-212ENST00000490639 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.422e-6■■■■□ 23.5
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CP-212ENST00000490639 FRMPD4Q14CM0 1322 aa6.2□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 H3BQV1 296 aa6.2□□□□□ -1.42
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CP-212ENST00000490639 TRIM29Q14134 588 aa6.2□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.2□□□□□ -1.42
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CP-212ENST00000490639 GALNT17Q6IS24 598 aa6.2□□□□□ -1.42
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CP-212ENST00000490639 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.2□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 CRYGNQ8WXF5 182 aa6.2□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.2□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 FLRT1Q9NZU1 646 aa6.2□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 KIF3AQ9Y496 699 aa6.2□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 RPTORQ8N122 1335 aa6.2□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 STRNO43815 780 aa6.19□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 BRD1O95696 1058 aa6.19□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 PDCP20941 246 aa6.19□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 PRKCZQ05513 592 aa6.19□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 RESTQ13127 1097 aa6.19□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 KCTD2Q14681 263 aa6.19□□□□□ -1.42
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CP-212ENST00000490639 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
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CP-212ENST00000490639 CCL14Q16627 93 aa6.19□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 MCTP1Q6DN14 999 aa6.19□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 FAM173BQ6P4H8 233 aa6.19□□□□□ -1.42
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CP-212ENST00000490639 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.18□□□□□ -1.42
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CP-212ENST00000490639 F13A1P00488 732 aa6.18□□□□□ -1.42
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CP-212ENST00000490639 SREBF1P36956 1147 aa6.18□□□□□ -1.42
CP-212ENST00000490639 FLT3LGP49771 235 aa6.18□□□□□ -1.42
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