RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461507.5

FDPS-204, Transcript of farnesyl diphosphate synthase, human

TSL 2

Gene FDPS, Length 1,022 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FDPS-204	ENST00000461507	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		14.76	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	RASIP1	Q5U651	963 aa		14.76	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		14.76	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		14.76	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	TMEM87B	Q96K49	555 aa		14.76	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		14.76	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	14.75	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	CPA1	P15085	419 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	RXRA	P19793	462 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	HSPA4	P34932	840 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	GHRHR	Q02643	423 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	14.75	□□□□□ -0.05	4e-7	■■□□□ 11.4
FDPS-204	ENST00000461507	ITGA7	Q13683	1181 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	HOMER1	Q86YM7	354 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	LY9	Q9HBG7	655 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		14.75	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	KLRF2	D3W0D1	207 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	PSMA5	P28066	241 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	GRM4	Q14833	912 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	MICU3	Q86XE3	530 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	SCFD2	Q8WU76	684 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	14.74	□□□□□ -0.05	4e-16	■■■□□ 14.6
FDPS-204	ENST00000461507	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		14.74	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	DDAH1	O94760	285 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	KIF5B	P33176	963 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	CPT1A	P50416	773 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	PDE4D	Q08499	809 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	PPP2R5B	Q15173	497 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	TMEM240	Q5SV17	173 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	TMTC2	Q8N394	836 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	TMEM199	Q8N511	208 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	MTMR8	Q96EF0	704 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		14.73	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	GBF1	Q92538	1859 aa		14.72	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507		A6NJR5	290 aa		14.72	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507		B4DLN1	442 aa		14.72	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	CSF2RA	P15509	400 aa		14.72	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		14.72	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	MTA3	Q9BTC8	594 aa		14.72	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		14.72	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	IL23A	Q9NPF7	189 aa		14.72	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	COL20A1	Q9P218	1284 aa		14.72	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	CDH23	Q9H251	3354 aa		14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	OPLAH	O14841	1288 aa		14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	B4GALT4	O60513	344 aa		14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	CALM1	P0DP23	149 aa		14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	CALM2	P0DP24	149 aa		14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	CALM3	P0DP25	149 aa		14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	CYP2C18	P33260	490 aa		14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	PSMC6	P62333	389 aa		14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507		Q6ZUG5	572 aa		14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	FBXO11	Q86XK2	927 aa		14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	FAM161B	Q96MY7	647 aa		14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	IWS1	Q96ST2	819 aa		14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	USP26	Q9BXU7	913 aa		14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	HIPK3	Q9H422	1215 aa		14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		14.71	□□□□□ -0.05
FDPS-204	ENST00000461507	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		14.7	□□□□□ -0.06

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