RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413507.3

LACTB-202, Transcript of lactamase beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LACTB, Length 2,978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB-202ENST00000413507 C6orf50Q9HD87 102 aa22.39■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 UFL1O94874 794 aa22.38■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 TNNI2P48788 182 aa22.38■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 USP14P54578 494 aa22.38■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 DEF6Q9H4E7 631 aa22.38■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 KRT83P78385 493 aa22.38■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 COG1Q8WTW3 980 aa22.38■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 RRAGAQ7L523 313 aa22.38■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.38■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 FAM204AQ9H8W3 233 aa22.38■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.38■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 SLC16A2P36021 539 aa22.37■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 GPSM2P81274 684 aa22.37■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 ZBED6P86452 979 aa22.37■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 KIF5AQ12840 1032 aa22.37■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 CALML4Q96GE6 196 aa22.37■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.37■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 GRB10Q13322 594 aa22.37■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.37■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 BUB1O43683 1085 aa22.36■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 RPS6KA4O75676 772 aa22.36■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 MMP14P50281 582 aa22.36■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 ARID5AQ03989 594 aa22.36■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 CALCRLQ16602 461 aa22.36■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.36■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 EXOC4Q96A65 974 aa22.36■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.36■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 RFC4P35249 363 aa22.36■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 SPA17Q15506 151 aa22.36■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 MEA1Q16626 185 aa22.36■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.36■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 SV2BQ7L1I2 683 aa22.36■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 TUBB2AQ13885 445 aa22.35■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 MFSD14BQ5SR56 506 aa22.35■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 TUBB2BQ9BVA1 445 aa22.35■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 AKR1B10O60218 316 aa22.35■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 RNF40O75150 1001 aa22.35■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 POLD4Q9HCU8 107 aa22.35■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 SCN7AQ01118 1682 aa22.35■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 BICDL2A1A5D9 508 aa22.35■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 GNA11P29992 359 aa22.35■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 PPARDQ03181 441 aa22.35■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 ECM1Q16610 540 aa22.35■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.35■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.35■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.35■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 PNMA5Q96PV4 448 aa22.35■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 NDST4Q9H3R1 872 aa22.35■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.35■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 LRRC53A6NM62 1247 aa22.34■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 RIMBP2O15034 1052 aa22.34■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 PTPROQ16827 1216 aa22.34■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.34■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 ANKS1AQ92625 1134 aa22.34■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.34■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 MARCH6O60337 910 aa22.34■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.34■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 CNPY4Q8N129 248 aa22.34■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.34■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 MXD3Q9BW11 206 aa22.34■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.34■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 CD209Q9NNX6 404 aa22.34■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 GBP3Q9H0R5 595 aa22.33■■□□□ 1.17
LACTB-202ENST00000413507 KIF11P52732 1056 aa22.33■■□□□ 1.16
LACTB-202ENST00000413507 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.33■■□□□ 1.16
LACTB-202ENST00000413507 DNAAF5Q86Y56 855 aa22.33■■□□□ 1.16
LACTB-202ENST00000413507 NGLY1Q96IV0 654 aa22.33■■□□□ 1.16
LACTB-202ENST00000413507 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.33■■□□□ 1.16
LACTB-202ENST00000413507 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
LACTB-202ENST00000413507 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
LACTB-202ENST00000413507 ACTN2P35609 894 aa22.32■■□□□ 1.16
LACTB-202ENST00000413507 GGCXP38435 758 aa22.32■■□□□ 1.16
LACTB-202ENST00000413507 PRPHP41219 470 aa22.32■■□□□ 1.16
LACTB-202ENST00000413507 GRAPQ13588 217 aa22.32■■□□□ 1.16
LACTB-202ENST00000413507 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
LACTB-202ENST00000413507 LEKR1Q6ZMV7 388 aa22.32■■□□□ 1.16
LACTB-202ENST00000413507 CNBD1Q8NA66 436 aa22.32■■□□□ 1.16
LACTB-202ENST00000413507 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
LACTB-202ENST00000413507 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
LACTB-202ENST00000413507 DDX12PQ92771 950 aa22.32■■□□□ 1.16
LACTB-202ENST00000413507 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
LACTB-202ENST00000413507 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.32■■□□□ 1.16
LACTB-202ENST00000413507 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms