RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 SHCBP1Q8NEM2 672 aa25.18■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 CRYGNQ8WXF5 182 aa25.18■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 MROH8Q9H579 483 aa25.18■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 LCTP09848 1927 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 AOC2O75106 756 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 PTMSP20962 102 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 PTGDRQ13258 359 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 JMYQ8N9B5 988 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 TAAR1Q96RJ0 339 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 PPP6R2O75170 966 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 ME1P48163 572 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 FAM110CQ1W6H9 321 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 PPP4R3AQ6IN85 833 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 PFASO15067 1338 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 WDR78Q5VTH9 848 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 PORCNQ9H237 461 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 EFCC1Q9HA90 598 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 CPA4Q9UI42 421 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 PCDHA7Q9UN72 937 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa25.15■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 TDP2O95551 362 aa25.15■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 CYP3A4P08684 503 aa25.15■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 UBXN2AP68543 259 aa25.15■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 TPRNQ4KMQ1 711 aa25.15■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 RMDN3Q96TC7 470 aa25.15■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.15■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 PLXNB2O15031 1838 aa25.15■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 RPTORQ8N122 1335 aa25.15■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 ADGRA2Q96PE1 1338 aa25.15■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 NEMFO60524 1076 aa25.14■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 TLR2O60603 784 aa25.14■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 UBE2HP62256 183 aa25.14■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 MOXD1Q6UVY6 613 aa25.14■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 C4orf32Q8N8J7 132 aa25.14■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CTU2-201ENST00000312060 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa25.13■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 CYP3A7P24462 503 aa25.13■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 ZNF76P36508 570 aa25.13■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 HTRA3P83110 453 aa25.13■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 ARHGEF16Q5VV41 709 aa25.13■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 PXMP2Q9NR77 195 aa25.13■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 ALDH1A1P00352 501 aa25.13■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 BCRP11274 1271 aa25.13■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 FCER1AP12319 257 aa25.13■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 KCTD2Q14681 263 aa25.13■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 MMP19Q99542 508 aa25.13■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 TMEM60Q9H2L4 133 aa25.13■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25.12■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 DOCK3Q8IZD9 2030 aa25.12■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 POTEB2H3BUK9 544 aa25.12■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 LAD1O00515 517 aa25.12■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 CA12O43570 354 aa25.12■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 SLC37A4O43826 429 aa25.12■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 PTPREP23469 700 aa25.12■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 CIITAP33076 1130 aa25.12■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 CRHR2Q13324 411 aa25.12■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 ADALQ6DHV7 355 aa25.12■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 C17orf99Q6UX52 265 aa25.12■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 POTEDQ86YR6 584 aa25.12■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 PGM5Q15124 567 aa25.11■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 MBOAT7Q96N66 472 aa25.11■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 PDCD2LQ9BRP1 358 aa25.11■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 FAM86B1E9PN63 330 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 FAM86B2P0C5J1 330 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 CNTN2Q02246 1040 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 CALCRLQ16602 461 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 DNERQ8NFT8 737 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 FERMT2Q96AC1 680 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 CUTAO60888 179 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 OR52Z1P0C646 297 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 VEGFBP49765 207 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 PRR16Q569H4 304 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 PCNX4Q63HM2 1172 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 IL31RAQ8NI17 732 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 CLIC6Q96NY7 704 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa25.09■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 MAP2K2P36507 400 aa25.09■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 Q4G0T1 1027 aa25.09■■□□□ 1.61
CTU2-201ENST00000312060 FAM133AQ8N9E0 248 aa25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms