RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000310032.12

TSPAN17-202, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-202ENST00000310032 LY75O60449 1722 aa22.12■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 ORC4O43929 436 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 CXCR5P32302 372 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 SH3GL2Q99962 352 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 SBF2Q86WG5 1849 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 PSMA7O14818 248 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 SCG2P13521 617 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 TRAPPC10P48553 1259 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 TTMPQ5BVD1 217 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 POLLQ9UGP5 575 aa22.11■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 GOLGA8KD6RF30 607 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 MOCS3O95396 460 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 C12orf60Q5U649 245 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 SHTN1A0MZ66 631 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 LRRC15Q8TF66 581 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 CD209Q9NNX6 404 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 NFRKBQ6P4R8 1299 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 CCDC42Q96M95 316 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 NUP58Q9BVL2 599 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 CALM1P0DP23 149 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 CALM2P0DP24 149 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 CALM3P0DP25 149 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 KCNB1Q14721 858 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 MCTP2Q6DN12 878 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.09■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 SPA17Q15506 151 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 GBP6Q6ZN66 633 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 PROM2Q8N271 834 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 TRIM58Q8NG06 486 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 POLD4Q9HCU8 107 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN17-202ENST00000310032 RHOBTB3O94955 611 aa22.08■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 PDCLQ13371 301 aa22.08■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 SBK1Q52WX2 424 aa22.08■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.08■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 CERKQ8TCT0 537 aa22.08■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 OSBPL9Q96SU4 736 aa22.08■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 RIMBP2O15034 1052 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 OPA1O60313 960 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 TACC1O75410 805 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 DDAH1O94760 285 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 MIIPQ5JXC2 388 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 RETREG2Q8NC44 543 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 MXD3Q9BW11 206 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 NCK2O43639 380 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 INPP5BP32019 993 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 BTDP43251 543 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 CRY2Q49AN0 593 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 KCTD16Q68DU8 428 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 SH2D4AQ9H788 454 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 STX8Q9UNK0 236 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 PNMA1Q8ND90 353 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 MYH10P35580 1976 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 F8W031 263 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 SLURP2P0DP57 97 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 ATP1A2P50993 1020 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 EPHB4P54760 987 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 BLIDQ8IZY5 108 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 P2RX5Q93086 422 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 ZIM3Q96PE6 472 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 RUFY1Q96T51 708 aa22.05■■□□□ 1.12
TSPAN17-202ENST00000310032 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms