RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566458.5

RNPS1-220, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RNPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-220ENST00000566458 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
RNPS1-220ENST00000566458 PTPRGP23470 1445 aa22.71■■□□□ 1.23
RNPS1-220ENST00000566458 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
RNPS1-220ENST00000566458 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.7■■□□□ 1.22
RNPS1-220ENST00000566458 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.7■■□□□ 1.22
RNPS1-220ENST00000566458 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
RNPS1-220ENST00000566458 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
RNPS1-220ENST00000566458 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.67■■□□□ 1.22
RNPS1-220ENST00000566458 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.66■■□□□ 1.22
RNPS1-220ENST00000566458 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
RNPS1-220ENST00000566458 TONSLQ96HA7 1378 aa22.65■■□□□ 1.22
RNPS1-220ENST00000566458 TRIM52Q96A61 297 aa22.63■■□□□ 1.21
RNPS1-220ENST00000566458 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.62■■□□□ 1.21
RNPS1-220ENST00000566458 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.62■■□□□ 1.21
RNPS1-220ENST00000566458 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.61■■□□□ 1.21
RNPS1-220ENST00000566458 ADGRL2O95490 1459 aa22.6■■□□□ 1.21
RNPS1-220ENST00000566458 NCOA1Q15788 1441 aa22.59■■□□□ 1.21
RNPS1-220ENST00000566458 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
RNPS1-220ENST00000566458 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.58■■□□□ 1.2
RNPS1-220ENST00000566458 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
RNPS1-220ENST00000566458 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.55■■□□□ 1.2
RNPS1-220ENST00000566458 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.54■■□□□ 1.2
RNPS1-220ENST00000566458 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.51■■□□□ 1.19
RNPS1-220ENST00000566458 ABCC2Q92887 1545 aa22.5■■□□□ 1.19
RNPS1-220ENST00000566458 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.5■■□□□ 1.19
RNPS1-220ENST00000566458 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.49■■□□□ 1.19
RNPS1-220ENST00000566458 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.48■■□□□ 1.19
RNPS1-220ENST00000566458 PREX2Q70Z35 1606 aa22.47■■□□□ 1.19
RNPS1-220ENST00000566458 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.47■■□□□ 1.19
RNPS1-220ENST00000566458 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
RNPS1-220ENST00000566458 PZPP20742 1482 aa22.45■■□□□ 1.18
RNPS1-220ENST00000566458 FOXD1Q16676 465 aa22.44■■□□□ 1.18
RNPS1-220ENST00000566458 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
RNPS1-220ENST00000566458 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.44■■□□□ 1.18
RNPS1-220ENST00000566458 MBD5Q9P267 1494 aa22.43■■□□□ 1.18
RNPS1-220ENST00000566458 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
RNPS1-220ENST00000566458 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.42■■□□□ 1.18
RNPS1-220ENST00000566458 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.42■■□□□ 1.18
RNPS1-220ENST00000566458 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.41■■□□□ 1.18
RNPS1-220ENST00000566458 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.189e-7■■□□□ 14
RNPS1-220ENST00000566458 TSPY4P0CV99 314 aa22.4■■□□□ 1.18
RNPS1-220ENST00000566458 TSPY10P0CW01 314 aa22.4■■□□□ 1.18
RNPS1-220ENST00000566458 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.39■■□□□ 1.17
RNPS1-220ENST00000566458 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.172e-9■■■□□ 17.5
RNPS1-220ENST00000566458 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
RNPS1-220ENST00000566458 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
RNPS1-220ENST00000566458 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.37■■□□□ 1.17
RNPS1-220ENST00000566458 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.37■■□□□ 1.17
RNPS1-220ENST00000566458 OSCARQ8IYS5 282 aa22.36■■□□□ 1.17
RNPS1-220ENST00000566458 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.36■■□□□ 1.17
RNPS1-220ENST00000566458 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
RNPS1-220ENST00000566458 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-220ENST00000566458 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-220ENST00000566458 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.34■■□□□ 1.17
RNPS1-220ENST00000566458 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.32■■□□□ 1.16
RNPS1-220ENST00000566458 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.31■■□□□ 1.16
RNPS1-220ENST00000566458 KIF15Q9NS87 1388 aa22.31■■□□□ 1.16
RNPS1-220ENST00000566458 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.31■■□□□ 1.16
RNPS1-220ENST00000566458 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.3■■□□□ 1.16
RNPS1-220ENST00000566458 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.29■■□□□ 1.16
RNPS1-220ENST00000566458 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.28■■□□□ 1.16
RNPS1-220ENST00000566458 PKD2Q13563 968 aa22.28■■□□□ 1.16
RNPS1-220ENST00000566458 NUP155O75694 1391 aa22.27■■□□□ 1.16
RNPS1-220ENST00000566458 PLCH2O75038 1416 aa22.25■■□□□ 1.15
RNPS1-220ENST00000566458 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
RNPS1-220ENST00000566458 KCNH8Q96L42 1107 aa22.24■■□□□ 1.15
RNPS1-220ENST00000566458 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
RNPS1-220ENST00000566458 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.23■■□□□ 1.15
RNPS1-220ENST00000566458 PLXNC1O60486 1568 aa22.2■■□□□ 1.14
RNPS1-220ENST00000566458 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-220ENST00000566458 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.19■■□□□ 1.14
RNPS1-220ENST00000566458 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.17■■□□□ 1.14
RNPS1-220ENST00000566458 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.16■■□□□ 1.14
RNPS1-220ENST00000566458 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-220ENST00000566458 ANP32CO43423 234 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-220ENST00000566458 UNC13BO14795 1591 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-220ENST00000566458 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.15■■□□□ 1.14
RNPS1-220ENST00000566458 CCER2I3L3R5 266 aa22.14■■□□□ 1.14
RNPS1-220ENST00000566458 ABCC1P33527 1531 aa22.14■■□□□ 1.13
RNPS1-220ENST00000566458 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.13■■□□□ 1.13
RNPS1-220ENST00000566458 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-220ENST00000566458 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.11■■□□□ 1.13
RNPS1-220ENST00000566458 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.09■■□□□ 1.13
RNPS1-220ENST00000566458 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RNPS1-220ENST00000566458 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.07■■□□□ 1.12
RNPS1-220ENST00000566458 ERBINQ96RT1 1412 aa22.07■■□□□ 1.12
RNPS1-220ENST00000566458 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.06■■□□□ 1.12
RNPS1-220ENST00000566458 CCDC7Q96M83 1385 aa22.05■■□□□ 1.12
RNPS1-220ENST00000566458 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
RNPS1-220ENST00000566458 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.05■■□□□ 1.12
RNPS1-220ENST00000566458 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.04■■□□□ 1.12
RNPS1-220ENST00000566458 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.03■■□□□ 1.12
RNPS1-220ENST00000566458 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.03■■□□□ 1.12
RNPS1-220ENST00000566458 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.03■■□□□ 1.12
RNPS1-220ENST00000566458 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.03■■□□□ 1.12
RNPS1-220ENST00000566458 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.01■■□□□ 1.11
RNPS1-220ENST00000566458 RALGAPBQ86X10 1494 aa22■■□□□ 1.11
RNPS1-220ENST00000566458 PLA2R1Q13018 1463 aa21.99■■□□□ 1.11
RNPS1-220ENST00000566458 KDM5CP41229 1560 aa21.98■■□□□ 1.11
RNPS1-220ENST00000566458 ASXL2Q76L83 1435 aa21.98■■□□□ 1.11
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