RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428344.1

AC008073.2-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AC008073.2, Length 792 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC008073.2-201ENST00000428344 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
AC008073.2-201ENST00000428344 FAM117AQ9C073 453 aa11.83□□□□□ -0.52
AC008073.2-201ENST00000428344 CCDC61Q9Y6R9 512 aa11.83□□□□□ -0.52
AC008073.2-201ENST00000428344 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
AC008073.2-201ENST00000428344 FLIIQ13045 1269 aa11.8□□□□□ -0.52
AC008073.2-201ENST00000428344 IFNL1Q8IU54 200 aa11.8□□□□□ -0.52
AC008073.2-201ENST00000428344 ZBTB7CA1YPR0 619 aa11.79□□□□□ -0.52
AC008073.2-201ENST00000428344 PITPNM1O00562 1244 aa11.79□□□□□ -0.52
AC008073.2-201ENST00000428344 CHADLQ6NUI6 762 aa11.79□□□□□ -0.52
AC008073.2-201ENST00000428344 DDRGK1Q96HY6 314 aa11.77□□□□□ -0.53
AC008073.2-201ENST00000428344 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
AC008073.2-201ENST00000428344 MS4A4AQ96JQ5 239 aa11.75□□□□□ -0.53
AC008073.2-201ENST00000428344 PLEKHG3A1L390 1219 aa11.73□□□□□ -0.53
AC008073.2-201ENST00000428344 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
AC008073.2-201ENST00000428344 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
AC008073.2-201ENST00000428344 MAP3K13O43283 966 aa11.71□□□□□ -0.53
AC008073.2-201ENST00000428344 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
AC008073.2-201ENST00000428344 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa11.69□□□□□ -0.54
AC008073.2-201ENST00000428344 DPYSL4O14531 572 aa11.68□□□□□ -0.54
AC008073.2-201ENST00000428344 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
AC008073.2-201ENST00000428344 A6NJR5 290 aa11.66□□□□□ -0.54
AC008073.2-201ENST00000428344 GPR37O15354 613 aa11.66□□□□□ -0.54
AC008073.2-201ENST00000428344 KIF12Q96FN5 646 aa11.66□□□□□ -0.54
AC008073.2-201ENST00000428344 TRAK2O60296 914 aa11.65□□□□□ -0.54
AC008073.2-201ENST00000428344 CCDC82Q8N4S0 544 aa11.65□□□□□ -0.54
AC008073.2-201ENST00000428344 CCDC102AQ96A19 550 aa11.65□□□□□ -0.54
AC008073.2-201ENST00000428344 GOLGA2Q08379 1002 aa11.64□□□□□ -0.55
AC008073.2-201ENST00000428344 MAP2K5Q13163 448 aa11.64□□□□□ -0.55
AC008073.2-201ENST00000428344 AMHR2Q16671 573 aa11.64□□□□□ -0.55
AC008073.2-201ENST00000428344 IRF6O14896 467 aa11.63□□□□□ -0.55
AC008073.2-201ENST00000428344 PDIA6Q15084 440 aa11.63□□□□□ -0.55
AC008073.2-201ENST00000428344 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.63□□□□□ -0.55
AC008073.2-201ENST00000428344 NECTIN2Q92692 538 aa11.63□□□□□ -0.55
AC008073.2-201ENST00000428344 CLUAP1Q96AJ1 413 aa11.63□□□□□ -0.55
AC008073.2-201ENST00000428344 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
AC008073.2-201ENST00000428344 GOPCQ9HD26 462 aa11.62□□□□□ -0.55
AC008073.2-201ENST00000428344 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
AC008073.2-201ENST00000428344 EMILIN3Q9NT22 766 aa11.62□□□□□ -0.55
AC008073.2-201ENST00000428344 NUTM2FA1L443 756 aa11.61□□□□□ -0.55
AC008073.2-201ENST00000428344 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
AC008073.2-201ENST00000428344 GRXCR2A6NFK2 248 aa11.55□□□□□ -0.56
AC008073.2-201ENST00000428344 GNPATO15228 680 aa11.55□□□□□ -0.56
AC008073.2-201ENST00000428344 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
AC008073.2-201ENST00000428344 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
AC008073.2-201ENST00000428344 DSG2Q14126 1118 aa11.52□□□□□ -0.57
AC008073.2-201ENST00000428344 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
AC008073.2-201ENST00000428344 TMEM106CQ9BVX2 250 aa11.51□□□□□ -0.57
AC008073.2-201ENST00000428344 HIC1Q14526 733 aa11.5□□□□□ -0.57
AC008073.2-201ENST00000428344 TRAIPQ9BWF2 469 aa11.49□□□□□ -0.57
AC008073.2-201ENST00000428344 FCHSD2O94868 740 aa11.48□□□□□ -0.57
AC008073.2-201ENST00000428344 FECHP22830 423 aa11.48□□□□□ -0.57
AC008073.2-201ENST00000428344 MCM6Q14566 821 aa11.48□□□□□ -0.57
AC008073.2-201ENST00000428344 KCTD17Q8N5Z5 321 aa11.48□□□□□ -0.57
AC008073.2-201ENST00000428344 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
AC008073.2-201ENST00000428344 MS4A1P11836 297 aa11.46□□□□□ -0.57
AC008073.2-201ENST00000428344 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
AC008073.2-201ENST00000428344 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
AC008073.2-201ENST00000428344 SERPINA10Q9UK55 444 aa11.46□□□□□ -0.57
AC008073.2-201ENST00000428344 MAP3K9P80192 1104 aa11.45□□□□□ -0.58
AC008073.2-201ENST00000428344 TMC2Q8TDI7 906 aa11.45□□□□□ -0.58
AC008073.2-201ENST00000428344 RAD21O60216 631 aa11.44□□□□□ -0.58
AC008073.2-201ENST00000428344 OSBPP22059 807 aa11.44□□□□□ -0.58
AC008073.2-201ENST00000428344 FOXK1P85037 733 aa11.44□□□□□ -0.58
AC008073.2-201ENST00000428344 AEBP1Q8IUX7 1158 aa11.43□□□□□ -0.58
AC008073.2-201ENST00000428344 SH3D19Q5HYK7 790 aa11.42□□□□□ -0.58
AC008073.2-201ENST00000428344 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP11.41□□□□□ -0.58
AC008073.2-201ENST00000428344 PLPP6Q8IY26 295 aa11.4□□□□□ -0.58
AC008073.2-201ENST00000428344 ZRANB1Q9UGI0 708 aa11.4□□□□□ -0.58
AC008073.2-201ENST00000428344 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
AC008073.2-201ENST00000428344 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
AC008073.2-201ENST00000428344 POM121Q96HA1 1249 aa11.38□□□□□ -0.59
AC008073.2-201ENST00000428344 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
AC008073.2-201ENST00000428344 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
AC008073.2-201ENST00000428344 PHF12Q96QT6 1004 aa11.37□□□□□ -0.59
AC008073.2-201ENST00000428344 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
AC008073.2-201ENST00000428344 OXER1Q8TDS5 423 aa11.34□□□□□ -0.59
AC008073.2-201ENST00000428344 DDX12PQ92771 950 aa11.34□□□□□ -0.59
AC008073.2-201ENST00000428344 PTGER2P43116 358 aa11.33□□□□□ -0.6
AC008073.2-201ENST00000428344 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
AC008073.2-201ENST00000428344 PTGDRQ13258 359 aa11.33□□□□□ -0.6
AC008073.2-201ENST00000428344 TRPC6Q9Y210 931 aa11.33□□□□□ -0.6
AC008073.2-201ENST00000428344 CLCN1P35523 988 aa11.32□□□□□ -0.6
AC008073.2-201ENST00000428344 DPY19L2Q6NUT2 758 aa11.32□□□□□ -0.6
AC008073.2-201ENST00000428344 MICALL2Q8IY33 904 aa11.32□□□□□ -0.6
AC008073.2-201ENST00000428344 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
AC008073.2-201ENST00000428344 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.6
AC008073.2-201ENST00000428344 TMCO4Q5TGY1 634 aa11.3□□□□□ -0.6
AC008073.2-201ENST00000428344 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
AC008073.2-201ENST00000428344 RETREG2Q8NC44 543 aa11.29□□□□□ -0.6
AC008073.2-201ENST00000428344 TMUB1Q9BVT8 246 aa11.29□□□□□ -0.6
AC008073.2-201ENST00000428344 PLSCR2Q9NRY7 297 aa11.29□□□□□ -0.6
AC008073.2-201ENST00000428344 C2orf72A6NCS6 295 aa11.28□□□□□ -0.6
AC008073.2-201ENST00000428344 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
AC008073.2-201ENST00000428344 RGS22Q8NE09 1264 aa11.28□□□□□ -0.6
AC008073.2-201ENST00000428344 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
AC008073.2-201ENST00000428344 GPCPD1Q9NPB8 672 aa11.28□□□□□ -0.6
AC008073.2-201ENST00000428344 POLR3EQ9NVU0 708 aa11.28□□□□□ -0.6
AC008073.2-201ENST00000428344 COG6Q9Y2V7 657 aa11.28□□□□□ -0.6
AC008073.2-201ENST00000428344 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
AC008073.2-201ENST00000428344 SPDYE5A6NIY4 337 aa11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms