RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234142.9

GREB1-201, Transcript of growth regulating estrogen receptor binding 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GREB1, Length 8,444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GREB1-201ENST00000234142 CLIP1P30622 1438 aa14.83□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 TMF1P82094 1093 aa14.82□□□□□ -0.04
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GREB1-201ENST00000234142 SCRIBQ14160 1630 aa14.81□□□□□ -0.04
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GREB1-201ENST00000234142 TPM2P07951 284 aa14.8□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.8□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 KCNH8Q96L42 1107 aa14.8□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 TPM1P09493 284 aa14.79□□□□□ -0.04
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GREB1-201ENST00000234142 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
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GREB1-201ENST00000234142 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa14.74□□□□□ -0.05
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GREB1-201ENST00000234142 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 MARCH6O60337 910 aa14.74□□□□□ -0.05
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GREB1-201ENST00000234142 KIF16BQ96L93 1317 aa14.73□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 MORC1Q86VD1 984 aa14.73□□□□□ -0.05
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GREB1-201ENST00000234142 TEX35Q5T0J7 233 aa14.72□□□□□ -0.05
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GREB1-201ENST00000234142 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 EEA1Q15075 1411 aa14.71□□□□□ -0.05
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GREB1-201ENST00000234142 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa14.7□□□□□ -0.06
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GREB1-201ENST00000234142 CHMP3Q9Y3E7 222 aa14.67□□□□□ -0.06
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GREB1-201ENST00000234142 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.6□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.6□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 LMOD3Q0VAK6 560 aa14.59□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 RDXP35241 583 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 DCTN1Q14203 1278 aa14.58□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 DCAF11Q8TEB1 546 aa14.58□□□□□ -0.07
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