RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234142.9

GREB1-201, Transcript of growth regulating estrogen receptor binding 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GREB1, Length 8,444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1-201ENST00000234142 GPS2Q13227 327 aa14.86□□□□□ -0.03
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GREB1-201ENST00000234142 KIF3AQ9Y496 699 aa14.86□□□□□ -0.03
GREB1-201ENST00000234142 RASSF8Q8NHQ8 419 aa14.85□□□□□ -0.03
GREB1-201ENST00000234142 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
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GREB1-201ENST00000234142 CLIP1P30622 1438 aa14.83□□□□□ -0.04
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GREB1-201ENST00000234142 SCRIBQ14160 1630 aa14.81□□□□□ -0.04
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GREB1-201ENST00000234142 TPM2P07951 284 aa14.8□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
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GREB1-201ENST00000234142 KCNH8Q96L42 1107 aa14.8□□□□□ -0.04
GREB1-201ENST00000234142 TPM1P09493 284 aa14.79□□□□□ -0.04
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GREB1-201ENST00000234142 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
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GREB1-201ENST00000234142 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.74□□□□□ -0.05
GREB1-201ENST00000234142 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
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GREB1-201ENST00000234142 KIF16BQ96L93 1317 aa14.73□□□□□ -0.05
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GREB1-201ENST00000234142 VPS53Q5VIR6 699 aa14.7□□□□□ -0.06
GREB1-201ENST00000234142 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa14.7□□□□□ -0.06
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GREB1-201ENST00000234142 CHMP3Q9Y3E7 222 aa14.67□□□□□ -0.06
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GREB1-201ENST00000234142 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.61□□□□□ -0.07
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GREB1-201ENST00000234142 RCAN3Q9UKA8 241 aa14.6□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa14.6□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.6□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.6□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 LMOD3Q0VAK6 560 aa14.59□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 RDXP35241 583 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 DCTN1Q14203 1278 aa14.58□□□□□ -0.07
GREB1-201ENST00000234142 DCAF11Q8TEB1 546 aa14.58□□□□□ -0.07
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