RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000219982.1

Trdn-208, Transcript of Triadin, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trdn, Length 4,149 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdn-208ENSMUST00000219982 SynmQ70IV5 1561 aa5.13□□□□□ -1.59
Trdn-208ENSMUST00000219982 Zbtb7bQ64321 544 aa5.13□□□□□ -1.59
Trdn-208ENSMUST00000219982 Supt16hQ920B9 1047 aa5.13□□□□□ -1.59
Trdn-208ENSMUST00000219982 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa5.13□□□□□ -1.59
Trdn-208ENSMUST00000219982 PygbQ8CI94 843 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
Trdn-208ENSMUST00000219982 Kdm5dQ62240 1548 aa5.13□□□□□ -1.59
Trdn-208ENSMUST00000219982 Zmym3Q9JLM4 1370 aa5.12□□□□□ -1.59
Trdn-208ENSMUST00000219982 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa5.12□□□□□ -1.59
Trdn-208ENSMUST00000219982 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa5.12□□□□□ -1.59
Trdn-208ENSMUST00000219982 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
Trdn-208ENSMUST00000219982 Ndufv2Q9D6J6 248 aa5.11□□□□□ -1.59
Trdn-208ENSMUST00000219982 ArxO35085 564 aa5.11□□□□□ -1.59
Trdn-208ENSMUST00000219982 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
Trdn-208ENSMUST00000219982 Znf703P0CL69 594 aa5.1□□□□□ -1.59
Trdn-208ENSMUST00000219982 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
Trdn-208ENSMUST00000219982 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
Trdn-208ENSMUST00000219982 Nom1Q3UFM5 854 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
Trdn-208ENSMUST00000219982 Ano8Q6PB70 1060 aa5.09□□□□□ -1.59
Trdn-208ENSMUST00000219982 Chrm1P12657 460 aa5.09□□□□□ -1.59
Trdn-208ENSMUST00000219982 Znf316Q6PGE4 1016 aa5.09□□□□□ -1.59
Trdn-208ENSMUST00000219982 MycnP03966 462 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Gtf2a1Q99PM3 378 aa5.08□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Anp32aO35381 247 aa5.08□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Tnnt3Q9QZ47 272 aa5.08□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Cep162Q6ZQ06 1403 aa5.08□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 BicraF8VPZ9 1578 aa5.08□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa5.07□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 PtprkP35822 1457 aa5.07□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Ccdc18Q640L5 1455 aa5.07□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Irx3P81067 507 aa5.07□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Pdcl3Q8BVF2 240 aa5.07□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Atad2Q8CDM1 1040 aa5.07□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Zbtb12Q9Z150 459 aa5.07□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Pcdhb17Q91VD8 799 aa5.06□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Gm38655A0A286YDK6 273 aa5.06□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Znf516Q7TSH3 1157 aa5.06□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Ccdc27Q3V036 639 aa5.05□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Golga3P55937 1487 aa5.05□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Trpm1Q2TV84 1622 aa5.05□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Igf1rQ60751 1373 aa5.05□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa5.04□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Rnf216P58283 853 aa5.04□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Skida1Q80YR3 822 aa5.04□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 DmtnQ9WV69 405 aa5.04□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Stk25Q9Z2W1 426 aa5.04□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Iqcf3Q9D498 203 aa5.04□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Kif21aQ9QXL2 1672 aa5.04□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Ttc41Q692V3 1318 aa5.03□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Pak3Q61036 559 aa5.03□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Map3k1P53349 1493 aa5.03□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Ube2q2Q8K2Z8 378 aa5.03□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa5.03□□□□□ -1.6
Trdn-208ENSMUST00000219982 Mbd5B1AYB6 1498 aa5.02□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Gpatch8A2A6A1 1505 aa5.02□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Nyap1Q6PFX7 833 aa5.02□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Baz1bQ9Z277 1479 aa5.02□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Tiam1Q60610 1591 aa5.02□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Nkx1-2P42580 305 aa5.02□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Slc24a3Q99PD7 645 aa5.02□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa5.01□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Setd1aE9PYH6 1716 aa5□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Cadps2Q8BYR5 1297 aa5□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa4.99□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Naip5Q9R016 1403 aa4.99□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Ipo9Q91YE6 1041 aa4.99□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Tex2Q6ZPJ0 1128 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Stk24Q99KH8 431 aa4.99□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 NrkQ9R0G8 1455 aa4.98□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Slc7a3P70423 618 aa4.98□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 TonslQ6NZL6 1363 aa4.98□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Cacnb1Q8R3Z5 597 aa4.98□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Pip4p2Q9CZX7 257 aa4.98□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Ak9G3UYQ4 1894 aa4.98□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 ChgaP26339 463 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Slain2Q8CI08 581 aa4.97□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Fyco1Q8VDC1 1437 aa4.97□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 1700006A11RikB9EHI3 544 aa4.97□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Arap1Q4LDD4 1452 aa4.97□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Prim1P20664 417 aa4.97□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Dnajc14Q921R4 703 aa4.97□□□□□ -1.61
Trdn-208ENSMUST00000219982 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
Trdn-208ENSMUST00000219982 Pde8bE9Q4S1 865 aa4.96□□□□□ -1.62
Trdn-208ENSMUST00000219982 Kif20aP97329 887 aa4.96□□□□□ -1.62
Trdn-208ENSMUST00000219982 Rbm10Q99KG3 930 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
Trdn-208ENSMUST00000219982 Ak7Q9D2H2 614 aa4.96□□□□□ -1.62
Trdn-208ENSMUST00000219982 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
Trdn-208ENSMUST00000219982 Ccer2J3QPU5 274 aa4.95□□□□□ -1.62
Trdn-208ENSMUST00000219982 Myt1lP97500 1187 aa4.95□□□□□ -1.62
Trdn-208ENSMUST00000219982 Sgip1Q8VD37 806 aa4.95□□□□□ -1.62
Trdn-208ENSMUST00000219982 Setd5Q5XJV7 1441 aa4.95□□□□□ -1.62
Trdn-208ENSMUST00000219982 SphkapQ6NSW3 1687 aa4.95□□□□□ -1.62
Trdn-208ENSMUST00000219982 Gcc2Q8CHG3 1679 aa4.95□□□□□ -1.62
Trdn-208ENSMUST00000219982 Cfap74Q3UY96 1578 aa4.95□□□□□ -1.62
Trdn-208ENSMUST00000219982 Mdc1Q5PSV9 1707 aa4.95□□□□□ -1.62
Trdn-208ENSMUST00000219982 Ncoa1P70365 1447 aa4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 112.7 ms