RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000167264.7

Gtf2e2-201, Transcript of General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf2e2, Length 1,566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Fancd2Q80V62 1450 aa23.68■■□□□ 1.38
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Mroh2aD3Z750 1679 aa23.67■■□□□ 1.38
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 NpatQ8BMA5 1420 aa23.66■■□□□ 1.38
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Pip4k2bQ80XI4 416 aa23.65■■□□□ 1.38
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 OvosQ3UU35 1456 aa23.64■■□□□ 1.38
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Atp10aO54827 1508 aa23.64■■□□□ 1.38
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Kiaa0556Q8C753 1610 aa23.64■■□□□ 1.38
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa23.6■■□□□ 1.37
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Abca9Q8K449 1623 aa23.58■■□□□ 1.37
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Ncoa2Q61026 1462 aa23.57■■□□□ 1.36
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Cux1P53564 1515 aa23.57■■□□□ 1.36
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Kif7B7ZNG0 1348 aa23.57■■□□□ 1.36
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Dip2aQ8BWT5 1523 aa23.57■■□□□ 1.36
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Yeats2Q3TUF7 1407 aa23.55■■□□□ 1.36
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Fyco1Q8VDC1 1437 aa23.52■■□□□ 1.36
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 BlmO88700 1416 aa23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Iqsec2Q5DU25 1478 aa23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Arhgap35Q91YM2 1499 aa23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Cul9Q80TT8 1865 aa23.47■■□□□ 1.35
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa23.46■■□□□ 1.35
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Magi1Q6RHR9 1471 aa23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Ptch1Q61115 1434 aa23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Hspa1lP16627 641 aa23.44■■□□□ 1.34
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Arap1Q4LDD4 1452 aa23.43■■□□□ 1.34
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Ankrd26Q811D2 1581 aa23.43■■□□□ 1.34
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Lemd3Q9WU40 921 aa23.43■■□□□ 1.34
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Clip1Q922J3 1391 aa23.41■■□□□ 1.34
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa23.4■■□□□ 1.34
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Prex2Q3LAC4 1598 aa23.4■■□□□ 1.34
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Talpid3E9PV87 1520 aa23.39■■□□□ 1.34
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Dip2cE9PWR4 1557 aa23.36■■□□□ 1.33
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Topaz1E5FYH1 1653 aa23.35■■□□□ 1.33
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa23.34■■□□□ 1.33
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Abca6Q8K441 1624 aa23.34■■□□□ 1.33
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Kif27Q7M6Z4 1394 aa23.32■■□□□ 1.32
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Cfap65Q3V0B4 1847 aa23.32■■□□□ 1.32
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 RereQ80TZ9 1558 aa23.3■■□□□ 1.32
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Myom2Q14BI5 1463 aa23.28■■□□□ 1.32
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa23.28■■□□□ 1.32
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Ncoa1P70365 1447 aa23.28■■□□□ 1.32
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa23.24■■□□□ 1.31
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Fam163aQ8CAA5 168 aa23.23■■□□□ 1.31
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Aebp1Q640N1 1128 aa23.23■■□□□ 1.31
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Kdm5cP41230 1554 aa23.22■■□□□ 1.31
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Erich3F6QRE9 1637 aa23.2■■□□□ 1.3
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Afap1Q80YS6 731 aa23.2■■□□□ 1.3
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Dip2bQ3UH60 1574 aa23.2■■□□□ 1.3
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Fbln2P37889 1221 aa23.18■■□□□ 1.3
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Arhgap5P97393 1501 aa23.17■■□□□ 1.3
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Bcl11bQ99PV8 884 aa23.15■■□□□ 1.3
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Gli3Q61602 1583 aa23.14■■□□□ 1.29
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Kidins220E9Q9B7 1793 aa23.12■■□□□ 1.29
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Ncoa3O09000 1398 aa23.12■■□□□ 1.29
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Hecw1Q8K4P8 1604 aa23.11■■□□□ 1.29
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Myt1lP97500 1187 aa23.1■■□□□ 1.29
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Bcl9Q9D219 1425 aa23.03■■□□□ 1.28
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Mug1P28665 1476 aa23.01■■□□□ 1.27
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa22.99■■□□□ 1.27
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Gab3Q8BSM5 595 aa22.99■■□□□ 1.27
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Trpm2Q91YD4 1506 aa22.98■■□□□ 1.27
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 AlkP97793 1621 aa22.98■■□□□ 1.27
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Rapgef3Q8VCC8 918 aa22.97■■□□□ 1.27
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa22.95■■□□□ 1.26
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa22.94■■□□□ 1.26
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Trappc8E9PWG2 1437 aa22.93■■□□□ 1.26
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Rims2Q9EQZ7 1530 aa22.93■■□□□ 1.26
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa22.93■■□□□ 1.26
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa22.92■■□□□ 1.26
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Cep162Q6ZQ06 1403 aa22.9■■□□□ 1.26
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Gm13697A2AK42 830 aa22.89■■□□□ 1.26
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Trpm1Q2TV84 1622 aa22.89■■□□□ 1.25
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 PzpQ61838 1495 aa22.84■■□□□ 1.25
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Abcc3B2RX12 1523 aa22.83■■□□□ 1.25
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Knl1Q66JQ7 1612 aa22.83■■□□□ 1.24
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Cfap74Q3UY96 1578 aa22.83■■□□□ 1.24
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 RictorQ6QI06 1708 aa22.81■■□□□ 1.24
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Tdrd9Q14BI7 1383 aa22.77■■□□□ 1.24
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Gli2Q0VGT2 1544 aa22.75■■□□□ 1.23
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Setd5Q5XJV7 1441 aa22.72■■□□□ 1.23
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa22.72■■□□□ 1.23
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Rsph4aQ8BYM7 716 aa22.72■■□□□ 1.23
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Naip6Q9JIB6 1403 aa22.71■■□□□ 1.23
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Map3k5O35099 1380 aa22.7■■□□□ 1.22
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Peg3Q3URU2 1571 aa22.68■■□□□ 1.22
Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 Tom1O88746 492 aa22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25 ms