RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000074721.5

Hoxd8-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Abca8bQ8K440 1620 aa47■■■■■ 5.12
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP46.99■■■■■ 5.11
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Arid3cA6PWV5 409 aa46.94■■■■■ 5.11
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa46.85■■■■■ 5.09
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa46.79■■■■■ 5.08
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Adcy10Q8C0T9 1614 aa46.78■■■■■ 5.08
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa46.75■■■■■ 5.07
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 A2mQ6GQT1 1474 aa46.73■■■■■ 5.07
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP46.72■■■■■ 5.07
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa46.7■■■■■ 5.07
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Rnf17Q99MV7 1640 aa46.69■■■■■ 5.07
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Zfyve16Q80U44 1528 aa46.66■■■■■ 5.06
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa46.63■■■■■ 5.05
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Arhgap5P97393 1501 aa46.6■■■■■ 5.05
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Caskin1Q6P9K8 1431 aa46.6■■■■■ 5.05
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa46.59■■■■■ 5.05
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Tdrd9Q14BI7 1383 aa46.58■■■■■ 5.05
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa46.53■■■■■ 5.04
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ttc37F8VPK0 1563 aa46.53■■■■■ 5.04
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Depdc5P61460 1591 aa46.53■■■■■ 5.04
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa46.47■■■■■ 5.03
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Abca9Q8K449 1623 aa46.42■■■■■ 5.02
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 AglF8VPN4 1532 aa46.39■■■■■ 5.02
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Trappc8E9PWG2 1437 aa46.39■■■■■ 5.02
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Abcc5Q9R1X5 1436 aa46.38■■■■■ 5.02
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Cfap74Q3UY96 1578 aa46.36■■■■■ 5.01
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP46.35■■■■■ 5.01
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP46.33■■■■■ 5.01
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Abcc3B2RX12 1523 aa46.31■■■■■ 5
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Plekhh2Q8C115 1491 aa46.29■■■■■ 5
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Naip2Q9QUK4 1447 aa46.26■■■■■ 5
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Kidins220E9Q9B7 1793 aa46.26■■■■■ 5
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Mtus2Q3UHD3 1353 aa46.23■■■■■ 4.99
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 AdgbG3UZ78 1657 aa46.2■■■■■ 4.99
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP46.19■■■■■ 4.99
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Chic2Q9D9G3 165 aa46.17■■■■■ 4.98
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Cabp1Q9JLK7 227 aa46.15■■■■■ 4.98
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Mier1Q5UAK0 511 aa46.12■■■■■ 4.97
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP46.12■■■■■ 4.97
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa46.1■■■■■ 4.97
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Il16O54824 1322 aa46.05■■■■■ 4.96
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 UacaQ8CGB3 1411 aa46.05■■■■■ 4.96
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Hecw1Q8K4P8 1604 aa46.03■■■■■ 4.96
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa46.02■■■■■ 4.96
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 SphkapQ6NSW3 1687 aa45.99■■■■■ 4.95
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lemd3Q9WU40 921 aa45.99■■■■■ 4.95
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Fndc1E9Q043 1732 aa45.98■■■■■ 4.95
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa45.97■■■■■ 4.95
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Mia2Q91ZV0 1396 aa45.95■■■■■ 4.95
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Kiaa0556Q8C753 1610 aa45.95■■■■■ 4.95
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa45.94■■■■■ 4.94
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Mast1Q9R1L5 1570 aa45.94■■■■■ 4.94
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Fmn2Q9JL04 1578 aa45.93■■■■■ 4.94
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Rfx7F8VPJ6 1459 aa45.93■■■■■ 4.94
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 OvosQ3UU35 1456 aa45.93■■■■■ 4.94
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Fhad1A6PWD2 1420 aa45.89■■■■■ 4.94
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Neurl4Q5NCX5 1563 aa45.87■■■■■ 4.93
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Kdm5cP41230 1554 aa45.86■■■■■ 4.93
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Vps8Q0P5W1 1427 aa45.84■■■■■ 4.93
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa45.79■■■■■ 4.92
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa45.78■■■■■ 4.92
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP45.76■■■■■ 4.92
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Map3k5O35099 1380 aa45.75■■■■■ 4.91
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ptch1Q61115 1434 aa45.73■■■■■ 4.91
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Synj2Q9D2G5 1434 aa45.73■■■■■ 4.91
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 NclP09405 707 aaKnown RBP45.72■■■■■ 4.91
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Hecw2Q6I6G8 1578 aa45.72■■■■■ 4.91
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Atp10aO54827 1508 aa45.71■■■■■ 4.91
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Prdm16A2A935 1275 aa45.68■■■■■ 4.9
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Dip2cE9PWR4 1557 aa45.66■■■■■ 4.9
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Nos1Q9Z0J4 1429 aa45.63■■■■■ 4.9
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 RereQ80TZ9 1558 aa45.62■■■■■ 4.89
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ssh2Q5SW75 1423 aa45.57■■■■■ 4.89
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP45.57■■■■■ 4.89
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP45.56■■■■■ 4.88
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Yeats2Q3TUF7 1407 aa45.55■■■■■ 4.88
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 AlkP97793 1621 aa45.54■■■■■ 4.88
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Dnajc5gQ8C632 165 aa45.53■■■■■ 4.88
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Zfp644E9QA22 1323 aa45.5■■■■■ 4.87
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Fhod3Q76LL6 1578 aa45.47■■■■■ 4.87
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Cul9Q80TT8 1865 aa45.47■■■■■ 4.87
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Abca17E9PX95 1733 aa45.44■■■■■ 4.86
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP45.43■■■■■ 4.86
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP45.42■■■■■ 4.86
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ube2uB1AUC4 352 aa45.41■■■■■ 4.86
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa45.4■■■■■ 4.86
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Trpm2Q91YD4 1506 aa45.36■■■■■ 4.85
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP45.33■■■■■ 4.85
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Qser1A2BIE1 1698 aa45.32■■■■■ 4.84
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP45.29■■■■■ 4.84
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ccer2J3QPU5 274 aa45.28■■■■■ 4.84
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa45.28■■■■■ 4.84
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP45.27■■■■■ 4.84
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gli2Q0VGT2 1544 aa45.27■■■■■ 4.84
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Kif3bQ61771 747 aa45.25■■■■■ 4.83
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Naip6Q9JIB6 1403 aa45.25■■■■■ 4.83
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Plppr3Q7TPB0 716 aa45.22■■■■■ 4.83
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa45.22■■■■■ 4.83
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Trpm1Q2TV84 1622 aa45.22■■■■■ 4.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10 ms