RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063116.9

Msx1-201, Transcript of Homeobox protein MSX-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Msx1, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa28.95■■■□□ 2.22
Msx1-201ENSMUST00000063116 Plekhh2Q8C115 1491 aa28.95■■■□□ 2.22
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rfx7F8VPJ6 1459 aa28.92■■■□□ 2.22
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cabp1Q9JLK7 227 aa28.9■■■□□ 2.22
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
Msx1-201ENSMUST00000063116 PtprtQ99M80 1454 aa28.89■■■□□ 2.22
Msx1-201ENSMUST00000063116 SphkapQ6NSW3 1687 aa28.89■■■□□ 2.22
Msx1-201ENSMUST00000063116 Caskin1Q6P9K8 1431 aa28.88■■■□□ 2.21
Msx1-201ENSMUST00000063116 Eid3Q3V124 375 aa28.88■■■□□ 2.21
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa28.87■■■□□ 2.21
Msx1-201ENSMUST00000063116 Wdr7Q920I9 1489 aa28.86■■■□□ 2.21
Msx1-201ENSMUST00000063116 Tdrd9Q14BI7 1383 aa28.85■■■□□ 2.21
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rnf17Q99MV7 1640 aa28.84■■■□□ 2.21
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mtus2Q3UHD3 1353 aa28.84■■■□□ 2.21
Msx1-201ENSMUST00000063116 Abca8bQ8K440 1620 aa28.83■■■□□ 2.21
Msx1-201ENSMUST00000063116 TonslQ6NZL6 1363 aa28.83■■■□□ 2.21
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fhod3Q76LL6 1578 aa28.82■■■□□ 2.2
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa28.82■■■□□ 2.2
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ccer2J3QPU5 274 aa28.81■■■□□ 2.2
Msx1-201ENSMUST00000063116 Il16O54824 1322 aa28.8■■■□□ 2.2
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
Msx1-201ENSMUST00000063116 Znf608Q56A10 1511 aa28.78■■■□□ 2.2
Msx1-201ENSMUST00000063116 Atp10dQ8K2X1 1416 aa28.78■■■□□ 2.2
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa28.78■■■□□ 2.2
Msx1-201ENSMUST00000063116 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa28.77■■■□□ 2.2
Msx1-201ENSMUST00000063116 Igf1rQ60751 1373 aa28.76■■■□□ 2.19
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cep170Q6A065 1588 aa28.76■■■□□ 2.19
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa28.75■■■□□ 2.19
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pcgf6Q99NA9 353 aa28.73■■■□□ 2.19
Msx1-201ENSMUST00000063116 Arhgap5P97393 1501 aa28.73■■■□□ 2.19
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa28.72■■■□□ 2.19
Msx1-201ENSMUST00000063116 AI481877A2ALV5 1481 aa28.7■■■□□ 2.19
Msx1-201ENSMUST00000063116 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
Msx1-201ENSMUST00000063116 Trappc8E9PWG2 1437 aa28.66■■■□□ 2.18
Msx1-201ENSMUST00000063116 NclP09405 707 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cfap74Q3UY96 1578 aa28.64■■■□□ 2.17
Msx1-201ENSMUST00000063116 Fmn2Q9JL04 1578 aa28.64■■■□□ 2.17
Msx1-201ENSMUST00000063116 AlkP97793 1621 aa28.63■■■□□ 2.17
Msx1-201ENSMUST00000063116 Setbp1Q9Z180 1582 aa28.63■■■□□ 2.17
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zfp644E9QA22 1323 aa28.62■■■□□ 2.17
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa28.61■■■□□ 2.17
Msx1-201ENSMUST00000063116 Abcc3B2RX12 1523 aa28.6■■■□□ 2.17
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ube2uB1AUC4 352 aa28.59■■■□□ 2.17
Msx1-201ENSMUST00000063116 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mast1Q9R1L5 1570 aa28.56■■■□□ 2.16
Msx1-201ENSMUST00000063116 Mphosph9A6H5Y1 991 aa28.55■■■□□ 2.16
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kidins220E9Q9B7 1793 aa28.54■■■□□ 2.16
Msx1-201ENSMUST00000063116 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa28.54■■■□□ 2.16
Msx1-201ENSMUST00000063116 Zfyve16Q80U44 1528 aa28.54■■■□□ 2.16
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kif21bQ9QXL1 1668 aa28.53■■■□□ 2.16
Msx1-201ENSMUST00000063116 Hecw1Q8K4P8 1604 aa28.53■■■□□ 2.16
Msx1-201ENSMUST00000063116 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.16
Msx1-201ENSMUST00000063116 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.16
Msx1-201ENSMUST00000063116 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa28.51■■■□□ 2.15
Msx1-201ENSMUST00000063116 Neurl4Q5NCX5 1563 aa28.5■■■□□ 2.15
Msx1-201ENSMUST00000063116 Gm156Q58A37 223 aa28.5■■■□□ 2.15
Msx1-201ENSMUST00000063116 Trpm2Q91YD4 1506 aa28.5■■■□□ 2.15
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
Msx1-201ENSMUST00000063116 Arid3cA6PWV5 409 aa28.46■■■□□ 2.15
Msx1-201ENSMUST00000063116 Abca9Q8K449 1623 aa28.46■■■□□ 2.15
Msx1-201ENSMUST00000063116 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ak9G3UYQ4 1894 aa28.44■■■□□ 2.14
Msx1-201ENSMUST00000063116 Adgrl3Q80TS3 1537 aa28.4■■■□□ 2.14
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ssh2Q5SW75 1423 aa28.39■■■□□ 2.13
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ttll5Q8CHB8 1328 aa28.35■■■□□ 2.13
Msx1-201ENSMUST00000063116 Sall2Q9QX96 1004 aa28.35■■■□□ 2.13
Msx1-201ENSMUST00000063116 Naip5Q9R016 1403 aa28.34■■■□□ 2.13
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pkd2O35245 966 aa28.33■■■□□ 2.13
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pprc1Q6NZN1 1644 aa28.31■■■□□ 2.12
Msx1-201ENSMUST00000063116 Col17a1Q07563 1470 aa28.28■■■□□ 2.12
Msx1-201ENSMUST00000063116 Wdr66E9Q743 1299 aa28.28■■■□□ 2.12
Msx1-201ENSMUST00000063116 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
Msx1-201ENSMUST00000063116 Asxl1P59598 1514 aa28.27■■■□□ 2.12
Msx1-201ENSMUST00000063116 Prdm16A2A935 1275 aa28.26■■■□□ 2.11
Msx1-201ENSMUST00000063116 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa28.26■■■□□ 2.11
Msx1-201ENSMUST00000063116 Abca17E9PX95 1733 aa28.25■■■□□ 2.11
Msx1-201ENSMUST00000063116 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
Msx1-201ENSMUST00000063116 Map3k5O35099 1380 aa28.24■■■□□ 2.11
Msx1-201ENSMUST00000063116 Pik3c2gO70167 1506 aa28.24■■■□□ 2.11
Msx1-201ENSMUST00000063116 Map4P27546 1125 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
Msx1-201ENSMUST00000063116 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
Msx1-201ENSMUST00000063116 Usp47Q8BY87 1376 aa28.21■■■□□ 2.11
Msx1-201ENSMUST00000063116 Trak1Q6PD31 939 aa28.2■■■□□ 2.11
Msx1-201ENSMUST00000063116 Camsap2Q8C1B1 1461 aa28.19■■■□□ 2.1
Msx1-201ENSMUST00000063116 PtprgQ05909 1442 aa28.18■■■□□ 2.1
Msx1-201ENSMUST00000063116 ClspnQ80YR7 1315 aa28.18■■■□□ 2.1
Msx1-201ENSMUST00000063116 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
Msx1-201ENSMUST00000063116 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
Msx1-201ENSMUST00000063116 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
Msx1-201ENSMUST00000063116 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
Msx1-201ENSMUST00000063116 Lemd3Q9WU40 921 aa28.14■■■□□ 2.09
Msx1-201ENSMUST00000063116 Nos1Q9Z0J4 1429 aa28.13■■■□□ 2.09
Msx1-201ENSMUST00000063116 ShprhQ7TPQ3 1674 aa28.13■■■□□ 2.09
Msx1-201ENSMUST00000063116 Depdc5P61460 1591 aa28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.2 ms