RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026252.13

Ldb1-201, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 1,718 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa27.63■■■□□ 2.01
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa27.6■■■□□ 2.01
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Mast1Q9R1L5 1570 aa27.21■■□□□ 1.95
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kif21bQ9QXL1 1668 aa27.21■■□□□ 1.95
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zfp644E9QA22 1323 aa27.2■■□□□ 1.95
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 AI481877A2ALV5 1481 aa27.2■■□□□ 1.94
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Trappc8E9PWG2 1437 aa27.19■■□□□ 1.94
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Neurl4Q5NCX5 1563 aa27.18■■□□□ 1.94
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa27.17■■□□□ 1.94
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pkd2O35245 966 aa27.1■■□□□ 1.93
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zfyve16Q80U44 1528 aa27.03■■□□□ 1.92
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ttll5Q8CHB8 1328 aa27.02■■□□□ 1.92
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Pik3c2gO70167 1506 aa27.01■■□□□ 1.91
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 PtprgQ05909 1442 aa26.88■■□□□ 1.89
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Ak9G3UYQ4 1894 aa26.87■■□□□ 1.89
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Gm13697A2AK42 830 aa26.87■■□□□ 1.89
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Adgrl3Q80TS3 1537 aa26.85■■□□□ 1.89
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Abca17E9PX95 1733 aa26.85■■□□□ 1.89
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Map3k5O35099 1380 aa26.83■■□□□ 1.89
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Asxl1P59598 1514 aa26.83■■□□□ 1.88
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Lemd3Q9WU40 921 aa26.82■■□□□ 1.88
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
Ldb1-201ENSMUST00000026252 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa26.79■■□□□ 1.88
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Ldb1-201ENSMUST00000026252 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.88
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