RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 H7C1D1 291 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 EPS15P42566 896 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CCZ1BP86790 482 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 PPP4R3AQ6IN85 833 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CABP7Q86V35 215 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 MICALL2Q8IY33 904 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 PSTPIP2Q9H939 334 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 KBTBD4Q9NVX7 518 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa9.25□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 IQCA1LA6NCM1 817 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 RAD21O60216 631 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 NDUFB10O96000 172 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 RPN1P04843 607 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 TNNI2P48788 182 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 SEMA3FQ13275 785 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 UBE2SQ16763 222 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 SPATA1Q5VX52 437 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC150Q8NCX0 1101 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 RASSF8Q8NHQ8 419 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 RRAGCQ9HB90 399 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 WDR90Q96KV7 1748 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 SHTN1A0MZ66 631 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 SLC37A4O43826 429 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 TBC1D12O60347 775 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 TDP2O95551 362 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 TECP42680 631 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 KCNB1Q14721 858 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CALCRLQ16602 461 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 BTNL9Q6UXG8 535 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 FAM83AQ86UY5 434 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 VSTM4Q8IW00 320 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 NMRK2Q9NPI5 230 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 HACL1Q9UJ83 578 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa9.24□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1W2PRG0 241 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 BMP3P12645 472 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 SKILP12757 684 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 PLCG1P19174 1290 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 TXKP42681 527 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 ARMCX5Q6P1M9 558 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC15Q8TF66 581 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 INTS13Q9NVM9 706 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 POTECB2RU33 542 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 KLRC4O43908 158 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 EPHX2P34913 555 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 PDIA5Q14554 519 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM266Q2M3C6 531 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 SYDE2Q5VT97 1194 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CDKAL1Q5VV42 579 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 KLHL10Q6JEL2 608 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 SAMD7Q7Z3H4 446 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 AMNQ9BXJ7 453 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 RAB34Q9BZG1 259 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 VEZTQ9HBM0 779 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1B0GTH6 734 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM232C9JQI7 657 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 RHOBTB3O94955 611 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.932e-10■■■□□ 14.6
PDE4D-208ENST00000502484 MMP14P50281 582 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 STX17P56962 302 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 AP3B2Q13367 1082 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CALML4Q96GE6 196 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 MYOZ2Q9NPC6 264 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 KCND1Q9NSA2 647 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 LRWD1Q9UFC0 647 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 PGAP2Q9UHJ9 254 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 RWDD2AQ9UIY3 292 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 CTNND2Q9UQB3 1225 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 TMX2Q9Y320 296 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 USP17L15C9J2P7 530 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 USP17L11C9JVI0 530 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 USP17L18D6R9N7 530 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 USP17L22D6RA61 530 aa9.22□□□□□ -0.93
PDE4D-208ENST00000502484 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.22□□□□□ -0.93
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