RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	NPR1	P16066	1061 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	MX1	P20591	662 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHKA1	P46020	1223 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	SETDB1	Q15047	1291 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP2B3	Q16720	1220 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	METTL24	Q5JXM2	366 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	STYK1	Q6J9G0	422 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL25	Q9H293	177 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	STK17A	Q9UEE5	414 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	POLL	Q9UGP5	575 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC01387	J3KSC0	135 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	FSCN2	O14926	492 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAGE1	O75459	146 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	SDS	P20132	328 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDE6B	P35913	854 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	GYG1	P46976	350 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRELP	P51888	382 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	MASTL	Q96GX5	879 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	NPHP1	O15259	732 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	BBOX1	O75936	387 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP5J	P18859	108 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	BMP6	P22004	513 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	NME2	P22392	152 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	SP8	Q8IXZ3	490 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	LPIN2	Q92539	896 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0A0MRY4	1105 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266		H0YIN7	160 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNB5	O14775	395 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	MCAM	P43121	646 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	LIG3	P49916	1009 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	RASGRF1	Q13972	1273 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBE4A	Q14139	1066 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDZD3	Q86UT5	571 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	STK35	Q8TDR2	534 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF384	Q8TF68	577 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	RHOV	Q96L33	236 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	RRAGC	Q9HB90	399 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	GGT7	Q9UJ14	662 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	AOX1	Q06278	1338 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	LTBP1	Q14766	1721 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22

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