RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CALML3P27482 149 aa30.7■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MFSD5Q6N075 450 aa30.7■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM126BQ8IXS8 530 aa30.7■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PNMA1Q8ND90 353 aa30.7■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KAT14Q9H8E8 782 aa30.7■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 B4E1Z4 1266 aa30.69■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM63BQ5T3F8 832 aa30.69■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKS1AQ92625 1134 aa30.68■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBA5Q9GZZ9 404 aa30.68■■■□□ 2.5
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DUSP28Q4G0W2 176 aa30.67■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC43A3Q8NBI5 491 aa30.67■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR11Q9BZH6 1224 aa30.67■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPVLQ9H3G5 476 aa30.67■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZSWIM5Q9P217 1185 aa30.67■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD4P01730 458 aa30.66■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP30.66■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITGA7Q13683 1181 aa30.66■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USH1GQ495M9 461 aa30.66■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT23Q9C075 422 aa30.66■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDE4AP27815 886 aa30.65■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDE4DQ08499 809 aa30.65■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM199Q8N511 208 aa30.65■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa30.65■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa30.65■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEMA6BQ9H3T3 888 aa30.65■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNNM2Q9H8M5 875 aa30.65■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASPRV1Q53RT3 343 aa30.64■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNERQ8NFT8 737 aa30.64■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNKSO95271 1327 aa30.64■■■□□ 2.5
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC22Q5TAA0 569 aa30.63■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGS22Q8NE09 1264 aa30.63■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP30.63■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBAC1Q9BSL1 405 aa30.63■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRIN2DO15399 1336 aa30.63■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0C4DFX4 3053 aa30.62■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSF2RAP15509 400 aa30.62■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADGRF4Q8IZF3 695 aa30.62■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL25Q9H293 177 aa30.62■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 B4DLN1 442 aa30.61■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EDNRBP24530 442 aa30.61■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSMC6P62333 389 aa30.61■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLR3EQ9NVU0 708 aa30.61■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABCB11O95342 1321 aa30.6■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP2C18P33260 490 aa30.6■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPT1AP50416 773 aa30.6■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM240Q5SV17 173 aa30.6■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C16orf59Q7L2K0 433 aa30.6■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR6J1Q8NGC5 347 aa30.6■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAF1Q9H063 256 aa30.6■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAD50Q92878 1312 aa30.59■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP2R5BQ15173 497 aa30.59■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCFD2Q8WU76 684 aa30.59■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRPV6Q9H1D0 765 aa30.59■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIPK3Q9H422 1215 aa30.59■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM265A0A087WTH1 108 aa30.58■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DLL1O00548 723 aa30.58■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP30.58■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 B4GALT4O60513 344 aa30.57■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYL3P08590 195 aa30.57■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACRP10323 421 aa30.57■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 QRICH1Q2TAL8 776 aa30.57■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RUFY2Q8WXA3 655 aa30.57■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VAT1LQ9HCJ6 419 aa30.57■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PURAQ00577 322 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF365Q70YC5 407 aa30.56■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXO11Q86XK2 927 aa30.56■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCF2L2Q86YR7 1114 aa30.56■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D5Q92609 795 aa30.56■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 JMJD4Q9H9V9 463 aa30.56■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL23AQ9NPF7 189 aa30.56■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJB2P25686 324 aa30.55■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UMODL1Q5DID0 1318 aa30.54■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TXNP10599 105 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRDNQ13061 729 aa30.54■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEC23AQ15436 765 aa30.54■■■□□ 2.48
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RASIP1Q5U651 963 aa30.54■■■□□ 2.48
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