RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.19■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.19■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 TXKP42681 527 aa20.18■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 NCAPHQ15003 741 aa20.18■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC17Q96LX7 622 aa20.18■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 TUBE1Q9UJT0 475 aa20.18■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 RASA3Q14644 834 aa20.18■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.18■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 MED15Q96RN5 788 aa20.18■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 HSD3B7Q9H2F3 369 aa20.18■□□□□ 0.82
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PDE4D-204ENST00000358923 TMEM179Q6ZVK1 233 aa20.17■□□□□ 0.82
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PDE4D-204ENST00000358923 C10orf67Q8IYJ2 551 aa20.17■□□□□ 0.82
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PDE4D-204ENST00000358923 CEP135Q66GS9 1140 aa20.17■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 TBC1D5Q92609 795 aa20.17■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 DPF2Q92785 391 aa20.17■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.17■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 ADCY7P51828 1080 aa20.16■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 TEX35Q5T0J7 233 aa20.16■□□□□ 0.82
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PDE4D-204ENST00000358923 PRKG1Q13976 671 aa20.16■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 ICE2Q659A1 982 aa20.16■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 GOLGA8FQ08AF8 430 aa20.16■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa20.16■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 SYT10Q6XYQ8 523 aa20.16■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.16■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 PLA2G4DQ86XP0 818 aa20.16■□□□□ 0.82
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PDE4D-204ENST00000358923 FAM151AQ8WW52 585 aa20.16■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 FERMT2Q96AC1 680 aa20.16■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 IFNKQ9P0W0 207 aa20.16■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.15■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 GNA11P29992 359 aa20.15■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC174Q6PII3 467 aa20.15■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 TXLNBQ8N3L3 684 aa20.15■□□□□ 0.82
PDE4D-204ENST00000358923 SMARCE1Q969G3 411 aa20.15■□□□□ 0.82
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PDE4D-204ENST00000358923 POTEMA6NI47 508 aa20.15■□□□□ 0.82
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PDE4D-204ENST00000358923 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
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PDE4D-204ENST00000358923 NEMFO60524 1076 aa20.14■□□□□ 0.81
PDE4D-204ENST00000358923 DPYDQ12882 1025 aa20.14■□□□□ 0.81
PDE4D-204ENST00000358923 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.14■□□□□ 0.81
PDE4D-204ENST00000358923 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.14■□□□□ 0.81
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PDE4D-204ENST00000358923 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PDE4D-204ENST00000358923 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.14■□□□□ 0.81
PDE4D-204ENST00000358923 E2F4Q16254 413 aa20.13■□□□□ 0.81
PDE4D-204ENST00000358923 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.13■□□□□ 0.81
PDE4D-204ENST00000358923 MYO1CO00159 1063 aa20.13■□□□□ 0.81
PDE4D-204ENST00000358923 TRAPPC10P48553 1259 aa20.13■□□□□ 0.81
PDE4D-204ENST00000358923 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.13■□□□□ 0.81
PDE4D-204ENST00000358923 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PDE4D-204ENST00000358923 HPS3Q969F9 1004 aa20.13■□□□□ 0.81
PDE4D-204ENST00000358923 ERO1AQ96HE7 468 aa20.13■□□□□ 0.81
PDE4D-204ENST00000358923 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
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PDE4D-204ENST00000358923 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
PDE4D-204ENST00000358923 NCAPGQ9BPX3 1015 aa20.12■□□□□ 0.81
PDE4D-204ENST00000358923 MYO3BQ8WXR4 1341 aa20.12■□□□□ 0.81
PDE4D-204ENST00000358923 UBA7P41226 1012 aa20.11■□□□□ 0.81
PDE4D-204ENST00000358923 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.11■□□□□ 0.81
PDE4D-204ENST00000358923 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.11■□□□□ 0.81
PDE4D-204ENST00000358923 MYO1BO43795 1136 aa20.11■□□□□ 0.81
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PDE4D-204ENST00000358923 HACL1Q9UJ83 578 aa20.11■□□□□ 0.81
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PDE4D-204ENST00000358923 INPP5BP32019 993 aa20.1■□□□□ 0.81
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