RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314499.11

CSRNP3-201, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CSRNP3, Length 11,788 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3-201ENST00000314499 SYCE1LA8MT33 242 aa5□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 HSPA13P48723 471 aa5□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 TRPC1P48995 793 aa5□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 SNX1Q13596 522 aa5□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 HORMAD1Q86X24 394 aa5□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 USP26Q9BXU7 913 aa5□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 MYH3P11055 1940 aa5□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 H7C0S8 307 aa5□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 ETF1P62495 437 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 KRT81Q14533 505 aa5□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 TEX2Q8IWB9 1127 aa5□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 CFAP36Q96G28 342 aa5□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 STMN3Q9NZ72 180 aa5□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 ZNF202O95125 648 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 KRT9P35527 623 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 RAB14P61106 215 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 MORF4L2Q15014 288 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 ARHGAP44Q17R89 818 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 NUDCD3Q8IVD9 361 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 TEX9Q8N6V9 391 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 GDPD2Q9HCC8 539 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 KRT87PA6NCN2 255 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 GSNP06396 782 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 LCA5Q86VQ0 697 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 GINS4Q9BRT9 223 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 PDE11AQ9HCR9 933 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 C1orf112Q9NSG2 853 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 VWA3AA6NCI4 1184 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 BAG2O95816 211 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 SYCP2LQ5T4T6 812 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 ARHGEF35A5YM69 484 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 RASSF9O75901 435 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 KRT75O95678 551 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 PDE6AP16499 860 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 ICA1LQ8NDH6 482 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 SNX5Q9Y5X3 404 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 TRIML2Q8N7C3 387 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 GID8Q9NWU2 228 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 STK17AQ9UEE5 414 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 ANAPC5Q9UJX4 755 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 KNL1Q8NG31 2342 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 KRT37O76014 449 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 TMED10P49755 219 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 IFT88Q13099 833 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 TTLL7Q6ZT98 887 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 EXOC8Q8IYI6 725 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 KIAA2013Q8IYS2 634 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 RHPN1Q8TCX5 695 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 NACA2Q9H009 215 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 BCL2L12Q9HB09 334 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 TNNQ9UQP3 1299 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 ATP10DQ9P241 1426 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 NINQ8N4C6 2090 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 IQCA1LA6NCM1 817 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 ZNF233A6NK53 670 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 NR1D1P20393 614 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 NWD1Q149M9 1564 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 TBCCQ15814 346 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 LONRF2Q1L5Z9 754 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 CEP55Q53EZ4 464 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 POTEAQ6S8J7 498 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 HDAC11Q96DB2 347 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 MRFAP1Q9Y605 127 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 KCNJ18B7U540 433 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 KCNJ12Q14500 433 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 FMO2Q99518 471 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 NBPF3Q9H094 633 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 BABAM1Q9NWV8 329 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 PARD3Q8TEW0 1356 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 ATP8B3O60423 1300 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 PTCH1Q13635 1447 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 DAB1O75553 588 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 GUCY2CP25092 1073 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 SKOR1P84550 965 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 ATP2B3Q16720 1220 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 C2CD5Q86YS7 1000 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 BBS5Q8N3I7 341 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 PBKQ96KB5 322 aa4.99□□□□□ -1.61
CSRNP3-201ENST00000314499 PANK2Q9BZ23 570 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms