RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 PXYLP1Q8TE99 480 aa24.32■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDX11Q96FC9 970 aa24.32■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPZ1Q9BXG8 430 aa24.32■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDC27P30260 824 aa24.32■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIB2Q92519 343 aa24.32■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 PNMA2Q9UL42 364 aa24.32■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 NFIBO00712 420 aa24.31■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYCP01106 439 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 HOXC6P09630 235 aa24.31■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMARCA1P28370 1054 aa24.31■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 RCAN1P53805 252 aa24.31■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 EVCP57679 992 aa24.31■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLEC4DQ8WXI8 215 aa24.31■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 BACH2Q9BYV9 841 aa24.31■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 FLRT1Q9NZU1 646 aa24.31■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 NEK4P51957 841 aa24.3■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARMC5Q96C12 935 aa24.3■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIF2CQ99661 725 aa24.3■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 AMNQ9BXJ7 453 aa24.3■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa24.29■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADD1P35611 737 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIM32Q13049 653 aa24.29■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 NSMFQ6X4W1 530 aa24.29■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC5A4Q9NY91 659 aa24.29■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa24.28■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa24.28■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 INHAP05111 366 aa24.28■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 AK2P54819 239 aa24.28■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF792Q3KQV3 632 aa24.28■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF333Q96JL9 665 aa24.28■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABCB11O95342 1321 aa24.28■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 HMGCRP04035 888 aa24.28■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP39A1Q9NYL5 469 aa24.28■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa24.28■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 CNTN2Q02246 1040 aa24.27■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 FUT2Q10981 343 aa24.27■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP2R5BQ15173 497 aa24.27■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAML3Q96JK9 1138 aa24.27■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 PFASO15067 1338 aa24.27■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 NID2Q14112 1375 aa24.26■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.26■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTPDC1A2A3K4 754 aa24.26■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC85CA6NKD9 419 aa24.26■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 STK3Q13188 491 aa24.26■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 TPCN1Q9ULQ1 816 aa24.26■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 LCTP09848 1927 aa24.26■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa24.26■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 POTEB2H3BUK9 544 aa24.25■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBXN2AP68543 259 aa24.25■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTFR1Q15390 333 aa24.25■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBC1D5Q92609 795 aa24.25■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP2C19P33261 490 aa24.24■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKRD1Q15327 319 aa24.24■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 OLFML2BQ68BL8 750 aa24.24■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC30A10Q6XR72 485 aa24.24■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNF207Q6ZRF8 634 aa24.24■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 V9GY48 417 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 CALML3P27482 149 aa24.24■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 MFSD14CQ5VZR4 134 aa24.24■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM133AQ8N9E0 248 aa24.24■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 FGD4Q96M96 766 aa24.24■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.24■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 MCM3APO60318 1980 aa24.23■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 OPLAHO14841 1288 aa24.23■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPFIA3O75145 1194 aa24.23■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 IGHA2P01877 340 aa24.23■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 RPS6P62753 249 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 SOWAHBA6NEL2 793 aa24.22■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCL5P13501 91 aa24.22■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRAF1Q13077 416 aa24.22■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 RGS22Q8NE09 1264 aa24.22■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 TINF2Q9BSI4 451 aa24.22■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 UNC93B1Q9H1C4 597 aa24.22■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 BRCA2P51587 3418 aa24.22■■□□□ 1.47
CCNDBP1-208ENST00000566515 NTRK3Q16288 839 aa24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83 ms