RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491260.2

C1orf143-202, Transcript of chromosome 1 open reading frame 143 (putative), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene C1orf143, Length 813 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf143-202ENST00000491260 USP48Q86UV5 1035 aa7.47□□□□□ -1.21
C1orf143-202ENST00000491260 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
C1orf143-202ENST00000491260 TMEM59LQ9UK28 342 aa7.47□□□□□ -1.21
C1orf143-202ENST00000491260 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
C1orf143-202ENST00000491260 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa7.47□□□□□ -1.21
C1orf143-202ENST00000491260 NOS1P29475 1434 aa7.46□□□□□ -1.21
C1orf143-202ENST00000491260 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa7.46□□□□□ -1.21
C1orf143-202ENST00000491260 RIMS2Q9UQ26 1411 aa7.46□□□□□ -1.21
C1orf143-202ENST00000491260 EP400Q96L91 3159 aa7.46□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 MEIS3P2A8K0S8 358 aa7.46□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 VAMP1P23763 118 aa7.46□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 MCM4P33991 863 aa7.46□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 ZNF165P49910 485 aa7.46□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 ERVFC1P60507 584 aa7.46□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 RACK1P63244 317 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 EGR3Q06889 387 aa7.46□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.46□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 SP110Q9HB58 689 aa7.46□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 KIF15Q9NS87 1388 aa7.46□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 MYO5BQ9ULV0 1848 aa7.45□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 PTPRUQ92729 1446 aa7.45□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 GCC2Q8IWJ2 1684 aa7.45□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 GLI1P08151 1106 aa7.45□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 HK2P52789 917 aa7.45□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 CCDC120Q96HB5 630 aa7.45□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa7.45□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 TBX22Q9Y458 520 aa7.45□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 ERBINQ96RT1 1412 aa7.44□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 LMTK2Q8IWU2 1503 aa7.44□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 HPXP02790 462 aa7.44□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 ZGLP1P0C6A0 271 aa7.44□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 MESP2Q0VG99 397 aa7.44□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 TMEM192Q8IY95 271 aa7.44□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 RNF34Q969K3 372 aa7.44□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 EBF1Q9UH73 591 aa7.44□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 KANK1Q14678 1352 aa7.44□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 DCCP43146 1447 aa7.44□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 TRPM2O94759 1503 aa7.43□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.43□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 TNFRSF10CO14798 259 aa7.43□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 YY1P25490 414 aa7.43□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 CCNFP41002 786 aa7.43□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 RNF4P78317 190 aa7.43□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 TEKQ02763 1124 aa7.43□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 NBPF9Q3BBW0 867 aa7.43□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 TMEM67Q5HYA8 995 aa7.43□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 TMC3Q7Z5M5 1100 aa7.43□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 SLC9A7Q96T83 725 aa7.43□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 HDAC8Q9BY41 377 aa7.43□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 ZNRF3Q9ULT6 936 aa7.43□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 ZNF281Q9Y2X9 895 aa7.43□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 BCL9LQ86UU0 1499 aa7.43□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa7.42□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 E9PSI1 815 aa7.42□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 ACRP10323 421 aa7.42□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 MLANAQ16655 118 aa7.42□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 PRR23BQ6ZRT6 265 aa7.42□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 SLC52A1Q9NWF4 448 aa7.42□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 FAM53CQ9NYF3 392 aa7.42□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 CLEC3AO75596 197 aa7.41□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 CHMP4BP1P59074 171 aa7.41□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa7.41□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa7.41□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.41□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 ABHD4Q8TB40 342 aa7.41□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 MYLIPQ8WY64 445 aa7.41□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 PIK3R4Q99570 1358 aa7.41□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 PTCH1Q13635 1447 aa7.41□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 CROCC2H7BZ55 1655 aa7.41□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 RAC2P15153 192 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 ZNF124Q15973 351 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 TIGD5Q53EQ6 642 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 DAGLBQ8NCG7 672 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 SLC6A18Q96N87 628 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 G6PC3Q9BUM1 346 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 GLI3P10071 1580 aa7.4□□□□□ -1.22
C1orf143-202ENST00000491260 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
C1orf143-202ENST00000491260 NALCNQ8IZF0 1738 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf143-202ENST00000491260 C1orf167Q5SNV9 1468 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf143-202ENST00000491260 RALGAPBQ86X10 1494 aa7.39□□□□□ -1.23
C1orf143-202ENST00000491260 ABCC5O15440 1437 aa7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms