RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 ZBTB17Q13105 803 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 RPS6KA2Q15349 733 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGAP44Q17R89 818 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 ATG3Q9NT62 314 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 HARSP12081 509 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 AP1ARQ63HQ0 302 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PQ27 194 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PQ64 194 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PQD8 194 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 UBE3CQ15386 1083 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 NAA35Q5VZE5 725 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 AMFRQ9UKV5 643 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 EHHADHQ08426 723 aa9.72□□□□□ -0.85
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PTPRM-202ENST00000400053 IFNL3Q8IZI9 196 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 TEKT1Q969V4 418 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 KIF2CQ99661 725 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 TOM1O60784 492 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 TBC1D8O95759 1140 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
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PTPRM-202ENST00000400053 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 VPS37BQ9H9H4 285 aa9.72□□□□□ -0.85
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PTPRM-202ENST00000400053 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 ZMYM6O95789 1325 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 GABPAQ06546 454 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 PLCB4Q15147 1175 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 USP31Q70CQ4 1352 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 LARGE1O95461 756 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
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PTPRM-202ENST00000400053 ZNF654Q8IZM8 581 aa9.72□□□□□ -0.85
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PTPRM-202ENST00000400053 RDH13Q8NBN7 331 aa9.72□□□□□ -0.85
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PTPRM-202ENST00000400053 NACA2Q9H009 215 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 NCAPD2Q15021 1401 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 GOLGA8OA6NCC3 632 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 GOLGA8NF8WBI6 632 aa9.71□□□□□ -0.85
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PTPRM-202ENST00000400053 IWS1Q96ST2 819 aa9.71□□□□□ -0.85
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PTPRM-202ENST00000400053 ADAM21Q9UKJ8 722 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 RCOR1Q9UKL0 485 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 H7C1D1 291 aa9.71□□□□□ -0.85
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PTPRM-202ENST00000400053 PDE8BO95263 885 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 BAG2O95816 211 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 IFNB1P01574 187 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 BCRP11274 1271 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 COPB1P53618 953 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
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PTPRM-202ENST00000400053 RBL2Q08999 1139 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 CASP8Q14790 479 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 NCAPH2Q6IBW4 605 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 CAPN12Q6ZSI9 719 aa9.71□□□□□ -0.86
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PTPRM-202ENST00000400053 KMT5BQ4FZB7 885 aa9.71□□□□□ -0.86
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PTPRM-202ENST00000400053 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 SDCCAG3Q96C92 435 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGEF35A5YM69 484 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 SLC39A14Q15043 492 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-202ENST00000400053 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.7□□□□□ -0.86
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