RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 CHGBP05060 677 aa18.28■□□□□ 0.52
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PACS1-201ENST00000320580 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PACS1-201ENST00000320580 RASSF10A6NK89 507 aa18.28■□□□□ 0.52
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PACS1-201ENST00000320580 MMEP08473 750 aa18.28■□□□□ 0.52
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PACS1-201ENST00000320580 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa18.28■□□□□ 0.52
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PACS1-201ENST00000320580 MB21D1Q8N884 522 aa18.28■□□□□ 0.52
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PACS1-201ENST00000320580 GCKRQ14397 625 aa18.27■□□□□ 0.52
PACS1-201ENST00000320580 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa18.27■□□□□ 0.52
PACS1-201ENST00000320580 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
PACS1-201ENST00000320580 MAST3O60307 1309 aa18.27■□□□□ 0.52
PACS1-201ENST00000320580 FAM170AA1A519 330 aa18.27■□□□□ 0.52
PACS1-201ENST00000320580 SEMA3EO15041 775 aa18.27■□□□□ 0.52
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PACS1-201ENST00000320580 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
PACS1-201ENST00000320580 TRIM37O94972 964 aa18.27■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
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PACS1-201ENST00000320580 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa18.26■□□□□ 0.51
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PACS1-201ENST00000320580 CDC25CP30307 473 aa18.26■□□□□ 0.51
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PACS1-201ENST00000320580 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa18.26■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 CHMP6Q96FZ7 201 aa18.26■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 RWDD2AQ9UIY3 292 aa18.26■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 SNX12Q9UMY4 172 aa18.26■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa18.26■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 TRAF5O00463 557 aa18.26■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 PSMD14O00487 310 aa18.26■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 BIRC3Q13489 604 aa18.26■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 SFMBT2Q5VUG0 894 aa18.26■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 KCNB2Q92953 911 aa18.26■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 SCTRP47872 440 aa18.26■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 CARSP49589 748 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 MCM8Q9UJA3 840 aa18.26■□□□□ 0.51
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PACS1-201ENST00000320580 QRICH2Q9H0J4 1663 aa18.25■□□□□ 0.51
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PACS1-201ENST00000320580 ERVK-24P63145 666 aa18.25■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 CROCCP2Q86T23 111 aa18.25■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
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PACS1-201ENST00000320580 PTPRMP28827 1452 aa18.25■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 KAT6BQ8WYB5 2073 aa18.25■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
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PACS1-201ENST00000320580 CTDSPL2Q05D32 466 aa18.25■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 FUKQ8N0W3 1084 aa18.25■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 VPS52Q8N1B4 723 aa18.25■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 RNF14Q9UBS8 474 aa18.25■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 KCNG1Q9UIX4 513 aa18.25■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 TRPC6Q9Y210 931 aa18.25■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa18.25■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 CFAP73A6NFT4 308 aa18.25■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 MAP7Q14244 749 aa18.25■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 SEPT2Q15019 361 aa18.25■□□□□ 0.51
PACS1-201ENST00000320580 KDM7AQ6ZMT4 941 aa18.25■□□□□ 0.51
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