RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295927.3

PTX3-201, Transcript of pentraxin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX3, Length 1,940 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3-201ENST00000295927 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 KLRG1Q96E93 195 aa25.98■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 FBXO28Q9NVF7 368 aa25.98■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 USP17L15C9J2P7 530 aa25.97■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.97■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 USP17L11C9JVI0 530 aa25.97■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 USP17L18D6R9N7 530 aa25.97■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 USP17L22D6RA61 530 aa25.97■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.97■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 USP17L19D6RCP7 530 aa25.97■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 USP17L20D6RJB6 530 aa25.97■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 LAD1O00515 517 aa25.97■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 USP17L24Q0WX57 530 aa25.97■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.97■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 PICK1Q9NRD5 415 aa25.97■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 KIAA1468Q9P260 1216 aa25.97■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 PHIPQ8WWQ0 1821 aa25.96■■□□□ 1.75
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PTX3-201ENST00000295927 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
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PTX3-201ENST00000295927 WDR18Q9BV38 432 aa25.96■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 PTPRAP18433 802 aa25.96■■□□□ 1.75
PTX3-201ENST00000295927 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
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PTX3-201ENST00000295927 MTMR2Q13614 643 aa25.96■■□□□ 1.75
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PTX3-201ENST00000295927 MEIS2O14770 477 aa25.95■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 NEMFO60524 1076 aa25.95■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 SPP2Q13103 211 aa25.95■■□□□ 1.74
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PTX3-201ENST00000295927 DLK2Q6UY11 383 aa25.95■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 DTHD1Q6ZMT9 781 aa25.95■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 SULF1Q8IWU6 871 aa25.95■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 PDILTQ8N807 584 aa25.95■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 AS3MTQ9HBK9 375 aa25.95■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 ADM5C9JUS6 153 aa25.94■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 LONP1P36776 959 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 PRPHP41219 470 aa25.94■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 TRAF1Q13077 416 aa25.94■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 CCDC174Q6PII3 467 aa25.94■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.94■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 SERTAD1Q9UHV2 236 aa25.94■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 A0A087X0B3 334 aa25.94■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 PRKG1Q13976 671 aa25.94■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 OPLAHO14841 1288 aa25.93■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 GRIN3BO60391 1043 aa25.93■■□□□ 1.74
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PTX3-201ENST00000295927 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
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PTX3-201ENST00000295927 TDP2O95551 362 aa25.92■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 VCAM1P19320 739 aa25.92■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 EPHX2P34913 555 aa25.92■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 AP3B2Q13367 1082 aa25.92■■□□□ 1.74
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PTX3-201ENST00000295927 POTEDQ86YR6 584 aa25.92■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 FAM200AQ8TCP9 573 aa25.92■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 SLF1Q9BQI6 1058 aa25.92■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 ANO3Q9BYT9 981 aa25.92■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 DNAJC25Q9H1X3 360 aa25.92■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.92■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 A0A087WWV3 80 aa25.91■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 PNOCQ13519 176 aa25.91■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 MCTP2Q6DN12 878 aa25.91■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.91■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
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PTX3-201ENST00000295927 FOXN1O15353 648 aa25.9■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 SLC37A4O43826 429 aa25.9■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
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PTX3-201ENST00000295927 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 TUBE1Q9UJT0 475 aa25.89■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 SCN4AP35499 1836 aa25.89■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 PARP14Q460N5 1801 aa25.89■■□□□ 1.74
PTX3-201ENST00000295927 CDC25AP30304 524 aa25.88■■□□□ 1.73
PTX3-201ENST00000295927 CALCRLQ16602 461 aa25.88■■□□□ 1.73
PTX3-201ENST00000295927 KANK3Q6NY19 840 aa25.88■■□□□ 1.73
PTX3-201ENST00000295927 LDHDQ86WU2 507 aa25.88■■□□□ 1.73
PTX3-201ENST00000295927 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
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