RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP1A3P13637 1013 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF408Q9H9D4 720 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD19P15391 556 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TCP10L2B9ZVM9 353 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GUCY2FP51841 1108 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM87AQ8NBN3 555 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATG3Q9NT62 314 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ENC1O14682 589 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP17L8P0C7I0 530 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM26FQ5R3K3 315 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM196AQ6ZSG2 479 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIAA1524Q8TCG1 905 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DYNLL2Q96FJ2 89 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SAMD15Q9P1V8 674 aa18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa18.34■□□□□ 0.53
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C6orf163Q5TEZ5 329 aa18.33■□□□□ 0.53
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTC14Q96N46 770 aa18.33■□□□□ 0.53
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ICA1Q05084 483 aa18.33■□□□□ 0.53
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC51Q96ER9 411 aa18.33■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFNAR1P17181 557 aa18.33■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRPC3Q13507 836 aa18.33■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARID5BQ14865 1188 aa18.33■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H7C1W4 665 aa18.33■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NOP56O00567 594 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ALDH1B1P30837 517 aa18.33■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC16A2P36021 539 aa18.33■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STAT1P42224 750 aa18.33■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPSTI1Q96J88 318 aa18.33■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERVV-1B6SEH8 477 aa18.32■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP2B4P23634 1241 aa18.32■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COPB1P53618 953 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TXNDC16Q9P2K2 825 aa18.32■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC41Q15345 812 aa18.32■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLFN13Q68D06 897 aa18.32■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC105Q8IYK2 499 aa18.32■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBL4BQ8N7F7 174 aa18.32■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP18.32■□□□□ 0.524e-8■■■■■ 57.5
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNK3O14649 394 aa18.32■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SUSD4Q5VX71 490 aa18.32■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GSDMAQ96QA5 445 aa18.32■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP6R2O75170 966 aa18.32■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP17L2Q6R6M4 530 aa18.32■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MSANTD4Q8NCY6 345 aa18.32■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa18.32■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PANK4Q9NVE7 773 aa18.32■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNNI1P19237 187 aa18.31■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBXN2AP68543 259 aa18.31■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCUN1D2Q6PH85 259 aa18.31■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC127Q96BQ5 260 aa18.31■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa18.31■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIAA1024Q9UPX6 916 aa18.31■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MMP1P03956 469 aa18.31■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PAK2Q13177 524 aa18.31■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADAM9Q13443 819 aa18.31■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa18.31■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BCRP11274 1271 aa18.31■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP18.31■□□□□ 0.524e-6■■■■□ 26.1
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRT71Q3SY84 523 aa18.31■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBXO11Q86XK2 927 aa18.31■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EXOC7Q9UPT5 735 aa18.31■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LONP1P36776 959 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCTD1Q719H9 257 aa18.3■□□□□ 0.52
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHURC1Q8WUH1 139 aa18.3■□□□□ 0.52
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