RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472218.1

RPS18-231, Transcript of ribosomal protein S18, human

TSL 2

Gene RPS18, Length 1,109 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS18-231	ENST00000472218	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	12.37	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		12.37	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		12.37	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	SPTLC2	O15270	562 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	SLC16A2	P36021	539 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	OAZ1	P54368	228 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	NR5A1	Q13285	461 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	AP3B2	Q13367	1082 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	VGLL4	Q14135	290 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	STK38	Q15208	465 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	ADAL	Q6DHV7	355 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	OXER1	Q8TDS5	423 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	MYH4	Q9Y623	1939 aa		12.36	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	PIK3CD	O00329	1044 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	LAD1	O00515	517 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	VCAM1	P19320	739 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	PPIL2	Q13356	520 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	MTMR2	Q13614	643 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	PTPA	Q15257	358 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	CPVL	Q9H3G5	476 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	ABCB11	O95342	1321 aa		12.35	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	DOCK1	Q14185	1865 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	ICAM1	P05362	532 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	ME1	P48163	572 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	FERMT2	Q96AC1	680 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	CLIC4	Q9Y696	253 aa		12.34	□□□□□ -0.43
RPS18-231	ENST00000472218	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	USP17L15	C9J2P7	530 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	USP17L11	C9JVI0	530 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	USP17L18	D6R9N7	530 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	USP17L22	D6RA61	530 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	USP17L19	D6RCP7	530 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	USP17L20	D6RJB6	530 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	ATP2A1	O14983	1001 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	CUTA	O60888	179 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	ZBED4	O75132	1171 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	CMA1	P23946	247 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	GHRHR	Q02643	423 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	USP17L24	Q0WX57	530 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	COG2	Q14746	738 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	TTC38	Q5R3I4	469 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	GPT2	Q8TD30	523 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	KIFC2	Q96AC6	838 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	COA7	Q96BR5	231 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	RRAGC	Q9HB90	399 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
RPS18-231	ENST00000472218	MYH6	P13533	1939 aa		12.33	□□□□□ -0.44

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