RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429762.7

VSX1-205, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSX1, Length 1,977 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-205ENST00000429762 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 CEP131Q9UPN4 1083 aa25.25■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 CMA1P23946 247 aa25.25■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 ADCY7P51828 1080 aa25.25■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 FEZ1Q99689 392 aa25.25■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 TSPY26PQ9H489 355 aa25.25■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 VCPKMTQ9H867 229 aa25.25■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.24■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 hCG_1984214I3L0E3 225 aa25.24■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 GNA11P29992 359 aa25.24■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 PRKG1Q13976 671 aa25.24■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 MAP3K11Q16584 847 aa25.24■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 UBE2SQ16763 222 aa25.24■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 PTPREP23469 700 aa25.24■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa25.24■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 ESYT2A0FGR8 921 aa25.23■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 KINO60870 393 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 RESP18Q5W5W9 173 aa25.23■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 DCAF15Q66K64 600 aa25.23■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 WRNIP1Q96S55 665 aa25.23■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 PRR12Q9ULL5 1215 aa25.23■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 DOCK1Q14185 1865 aa25.23■■□□□ 1.63
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VSX1-205ENST00000429762 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 RNF214Q8ND24 703 aa25.22■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 PANK2Q9BZ23 570 aa25.22■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 ADM5C9JUS6 153 aa25.22■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 TRAPPC10P48553 1259 aa25.22■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 CSRNP2Q9H175 543 aa25.22■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 SH2D4AQ9H788 454 aa25.22■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 MRE11P49959 708 aa25.21■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 STAT2P52630 851 aa25.21■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 BTNL9Q6UXG8 535 aa25.21■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 KRT25Q7Z3Z0 450 aa25.21■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 FUCA2Q9BTY2 467 aa25.21■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa25.21■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
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VSX1-205ENST00000429762 KIFC2Q96AC6 838 aa25.2■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 FBXO28Q9NVF7 368 aa25.2■■□□□ 1.63
VSX1-205ENST00000429762 ZNF202O95125 648 aa25.2■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 USP49Q70CQ1 688 aa25.2■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 RIC8AQ9NPQ8 531 aa25.2■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 HPSEQ9Y251 543 aa25.2■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
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VSX1-205ENST00000429762 SCYL3Q8IZE3 742 aa25.18■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 TBCKQ8TEA7 893 aa25.18■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.18■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 VWA3AA6NCI4 1184 aa25.18■■□□□ 1.62
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VSX1-205ENST00000429762 DPY19L2Q6NUT2 758 aa25.18■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
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VSX1-205ENST00000429762 PSTPIP2Q9H939 334 aa25.18■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.18■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 SMCHD1A6NHR9 2005 aa25.17■■□□□ 1.62
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VSX1-205ENST00000429762 C4orf32Q8N8J7 132 aa25.17■■□□□ 1.62
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VSX1-205ENST00000429762 TMEM60Q9H2L4 133 aa25.17■■□□□ 1.62
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VSX1-205ENST00000429762 USP17L11C9JVI0 530 aa25.16■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 USP17L18D6R9N7 530 aa25.16■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 USP17L22D6RA61 530 aa25.16■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.16■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 USP17L19D6RCP7 530 aa25.16■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 USP17L20D6RJB6 530 aa25.16■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 BMP15O95972 392 aa25.16■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 USP17L24Q0WX57 530 aa25.16■■□□□ 1.62
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VSX1-205ENST00000429762 HOOK2Q96ED9 719 aa25.16■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 SDF4Q9BRK5 362 aa25.16■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa25.15■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 CLK2P49760 499 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 TYRO3Q06418 890 aa25.15■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 SPP2Q13103 211 aa25.15■■□□□ 1.62
VSX1-205ENST00000429762 NEK8Q86SG6 692 aa25.15■■□□□ 1.62
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