RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429374.5

HDAC10-204, Transcript of histone deacetylase 10, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HDAC10, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10-204ENST00000429374 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HDAC10-204ENST00000429374 CAP2P40123 477 aa21.6■■□□□ 1.05
HDAC10-204ENST00000429374 JAG1P78504 1218 aa21.6■■□□□ 1.05
HDAC10-204ENST00000429374 TRAF1Q13077 416 aa21.6■■□□□ 1.05
HDAC10-204ENST00000429374 IQCB1Q15051 598 aa21.6■■□□□ 1.05
HDAC10-204ENST00000429374 NEK8Q86SG6 692 aa21.6■■□□□ 1.05
HDAC10-204ENST00000429374 RASGRP4Q8TDF6 673 aa21.6■■□□□ 1.05
HDAC10-204ENST00000429374 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.6■■□□□ 1.05
HDAC10-204ENST00000429374 SH2D4AQ9H788 454 aa21.6■■□□□ 1.05
HDAC10-204ENST00000429374 SPON1Q9HCB6 807 aa21.6■■□□□ 1.05
HDAC10-204ENST00000429374 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.6■■□□□ 1.05
HDAC10-204ENST00000429374 USP17L10C9JJH3 530 aa21.59■■□□□ 1.05
HDAC10-204ENST00000429374 PLA2G6O60733 806 aa21.59■■□□□ 1.05
HDAC10-204ENST00000429374 NDUFB10O96000 172 aa21.59■■□□□ 1.05
HDAC10-204ENST00000429374 BMP3P12645 472 aa21.59■■□□□ 1.05
HDAC10-204ENST00000429374 INF2Q27J81 1249 aa21.59■■□□□ 1.05
HDAC10-204ENST00000429374 NT5DC1Q5TFE4 455 aa21.59■■□□□ 1.05
HDAC10-204ENST00000429374 GOPCQ9HD26 462 aa21.59■■□□□ 1.05
HDAC10-204ENST00000429374 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
HDAC10-204ENST00000429374 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
HDAC10-204ENST00000429374 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
HDAC10-204ENST00000429374 CUL5Q93034 780 aa21.58■■□□□ 1.05
HDAC10-204ENST00000429374 COA7Q96BR5 231 aa21.58■■□□□ 1.05
HDAC10-204ENST00000429374 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 ASNSP08243 561 aa21.58■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 SLFN14P0C7P3 912 aa21.58■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 RASSF7Q02833 373 aa21.58■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 SPECC1Q5M775 1068 aa21.58■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 DTHD1Q6ZMT9 781 aa21.58■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 LUZP1Q86V48 1076 aa21.58■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.58■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 A0A1W2PRG0 241 aa21.57■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 VWA3AA6NCI4 1184 aa21.57■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 SLC16A2P36021 539 aa21.57■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 PRELPP51888 382 aa21.57■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 RASA3Q14644 834 aa21.57■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 MICALL2Q8IY33 904 aa21.57■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.57■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 AK8Q96MA6 479 aa21.57■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 ADCY5O95622 1261 aa21.56■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 SARSP49591 514 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 POSTNQ15063 836 aa21.56■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.56■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 SYDE2Q5VT97 1194 aa21.56■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa21.56■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 SPATA20Q8TB22 786 aa21.56■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 EPSTI1Q96J88 318 aa21.56■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 TEPSINQ96N21 525 aa21.56■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 SERTAD1Q9UHV2 236 aa21.56■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.55■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 TXLNAP40222 546 aa21.55■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 IL17AQ16552 155 aa21.55■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 USP49Q70CQ1 688 aa21.55■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 IQUBQ8NA54 791 aa21.55■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 TBCKQ8TEA7 893 aa21.55■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 HOOK2Q96ED9 719 aa21.55■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 AMNQ9BXJ7 453 aa21.55■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.55■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 CCDC39Q9UFE4 941 aa21.55■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 SARM1Q6SZW1 724 aa21.55■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 CCSER1Q9C0I3 900 aa21.55■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 ATAD5Q96QE3 1844 aa21.54■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 PHF20L1A8MW92 1017 aa21.54■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 BECN2A8MW95 431 aa21.54■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 TMEM232C9JQI7 657 aa21.54■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 H7C1D1 291 aa21.54■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 LMNB1P20700 586 aa21.54■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 PNOCQ13519 176 aa21.54■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.54■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 CHURC1Q8WUH1 139 aa21.54■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 VCPKMTQ9H867 229 aa21.54■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa21.54■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa21.54■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 SHTN1A0MZ66 631 aa21.53■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 SMTNL1A8MU46 457 aa21.53■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 IKBKBO14920 756 aa21.53■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 NEMFO60524 1076 aa21.53■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 SMC2O95347 1197 aa21.53■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 OR52Z1P0C646 297 aa21.53■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 LETM2Q2VYF4 491 aa21.53■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.53■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.53■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 RAD21O60216 631 aa21.52■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 STAT2P52630 851 aa21.52■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 SEMA3FQ13275 785 aa21.52■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 AP3B2Q13367 1082 aa21.52■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 E2F4Q16254 413 aa21.52■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa21.52■■□□□ 1.04
HDAC10-204ENST00000429374 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms