RNA–Protein interactions for RNA: YNL205C

YNL205C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL205C, Length 423 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL205C	YNL205C	THI20	Q08224	551 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	NUR1	Q12066	484 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	YRM1	Q12340	786 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	ARP6	Q12509	438 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.45	□□□□□ -2.34	not detected
YNL205C	YNL205C	ECM10	P39987	644 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	YTA12	P40341	825 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	SHY1	P53266	389 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	HST1	P53685	503 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	ATG26	Q06321	1198 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	ENT4	Q07872	247 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	PEX15	Q08215	383 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	ATR1	P13090	542 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	CBF2	P32504	956 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	PAH1	P32567	862 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	VPS17	P32913	551 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	MIA40	P36046	403 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	GEX2	P36173	615 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	MRX1	P40050	688 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	SWP82	P43554	623 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	YGL082W	P53155	381 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	CIA1	Q05583	330 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	CRN1	Q06440	651 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	TRE2	Q08693	809 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	SLX4	Q12098	748 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	PET122	P10355	254 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	SNF3	P10870	884 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	TAF5	P38129	798 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	SHO1	P40073	367 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	CAB2	P40506	365 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	NNF2	P53253	936 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	RSM28	Q03430	361 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	ATG23	Q06671	453 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	VAM6	Q07468	1049 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	YOL057W	Q08225	711 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	CTF3	Q12748	733 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	PGS1	P25578	521 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	RCK2	P38623	610 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	UBA4	P38820	440 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	ALG8	P40351	577 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	REE1	P40893	198 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	YJR142W	P47173	342 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	CTF18	P49956	741 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	INN1	P53901	409 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	YMR027W	Q04371	470 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	SSK1	Q07084	712 aa		0.42	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	CHS1	P08004	1131 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.41	□□□□□ -2.34	not detected
YNL205C	YNL205C	RIT1	P23796	513 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	SNC1	P31109	117 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	SDS22	P36047	338 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	PIM1	P36775	1133 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	ANS1	P38832	159 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	SAW1	P39735	261 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	MAD3	P47074	515 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	YPL014W	Q02606	381 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	IES4	Q08561	116 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	SWT1	Q12104	458 aa		0.41	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
YNL205C	YNL205C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YNL205C	YNL205C	APE1	P14904	514 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YNL205C	YNL205C	SIR1	P21691	654 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YNL205C	YNL205C	MRP4	P32902	394 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YNL205C	YNL205C	ESL2	P36168	1195 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YNL205C	YNL205C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YNL205C	YNL205C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YNL205C	YNL205C	HAT2	P39984	401 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YNL205C	YNL205C	TMA108	P40462	946 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YNL205C	YNL205C	ERR3	P42222	437 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YNL205C	YNL205C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YNL205C	YNL205C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
YNL205C	YNL205C	SYO1	Q07395	620 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YNL205C	YNL205C	PRM7	Q12459	698 aa		0.4	□□□□□ -2.35
YNL205C	YNL205C	KAR1	P11927	433 aa		0.39	□□□□□ -2.35
YNL205C	YNL205C	HEM15	P16622	393 aa		0.39	□□□□□ -2.35

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 36.1 ms