RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 HLA-DPA1P20036 260 aa20.34■□□□□ 0.85
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PTPRJ-207ENST00000613246 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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PTPRJ-207ENST00000613246 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.32■□□□□ 0.84
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PTPRJ-207ENST00000613246 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.3■□□□□ 0.84
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PTPRJ-207ENST00000613246 NBPF14Q5TI25 921 aa20.3■□□□□ 0.84
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PTPRJ-207ENST00000613246 KCTD16Q68DU8 428 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 DEPTORQ8TB45 409 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 V9GY48 417 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 NCAPD3P42695 1498 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRJ-207ENST00000613246 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
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