RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM76AQ8TAV0 307 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 NELFBQ8WX92 580 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 TNFRSF25Q93038 417 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 DESI2Q9BSY9 194 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 CCSER1Q9C0I3 900 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 RNF39Q9H2S5 420 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 PRDM11Q9NQV5 511 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 GGA2Q9UJY4 613 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 MYH8P13535 1937 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF804BA4D1E1 1349 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP8B3O60423 1300 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 H3BQF6 201 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 hCG_1984214I3L0E3 225 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 SRGNP10124 158 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 SCG2P13521 617 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 STAT6P42226 847 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 PHKA1P46020 1223 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 EPHB4P54760 987 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 VSNL1P62760 191 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 UBXN1Q04323 297 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC122Q5T0U0 273 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 PDXDC2PQ6P474 469 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 ADSSL1Q8N142 457 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 C3orf20Q8ND61 904 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 JAKMIP2Q96AA8 810 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM89AQ96GI7 184 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 ERGIC2Q96RQ1 377 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 RUFY1Q96T51 708 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 DEF6Q9H4E7 631 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 GREM2Q9H772 168 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF287Q9HBT7 754 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 TOMM22Q9NS69 142 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 GJB4Q9NTQ9 266 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 EXOC1Q9NV70 894 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 LRP2BPQ9P2M1 347 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 DENND2AQ9ULE3 1009 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 CTNND2Q9UQB3 1225 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 ITGB4P16144 1822 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF831Q5JPB2 1677 aa8.65□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 GOLGA6BA6NDN3 693 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 EBAG9O00559 213 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 CES2O00748 559 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 FOXN1O15353 648 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 TEX33O43247 280 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 RNF40O75150 1001 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 ANXA13P27216 316 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 SMARCA1P28370 1054 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 PAFAH1B1P43034 410 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 VAV2P52735 878 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 SETQ01105 290 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 FUT2Q10981 343 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 PTGDRQ13258 359 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 RASGRF1Q13972 1273 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 UBE4AQ14139 1066 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 SEPT2Q15019 361 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 SBK1Q52WX2 424 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 EMC10Q5UCC4 262 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 KLHL10Q6JEL2 608 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 CNNM4Q6P4Q7 775 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 DTHD1Q6ZMT9 781 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF34Q8IZ26 560 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 CAGE1Q8TC20 777 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 NUP133Q8WUM0 1156 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 CAVIN3Q969G5 261 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 MED15Q96RN5 788 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 PNKPQ96T60 521 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 DISC1Q9NRI5 854 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 HPCAL4Q9UM19 191 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 KCNJ14Q9UNX9 436 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 FAN1Q9Y2M0 1017 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 NHSL1Q5SYE7 1610 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 PHLPP1O60346 1717 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 SCN7AQ01118 1682 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 XDHP47989 1333 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 GRID2IPA4D2P6 1211 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 GOLGA6CA6NDK9 693 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
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