RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567828.1

PPP4C-212, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 3

Gene PPP4C, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-212ENST00000567828 TEX13BQ9BXU2 312 aa26.97■■□□□ 1.91
PPP4C-212ENST00000567828 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa26.97■■□□□ 1.91
PPP4C-212ENST00000567828 LAMA4Q16363 1823 aa26.97■■□□□ 1.91
PPP4C-212ENST00000567828 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
PPP4C-212ENST00000567828 LRRC26Q2I0M4 334 aa26.96■■□□□ 1.91
PPP4C-212ENST00000567828 SLFN13Q68D06 897 aa26.96■■□□□ 1.91
PPP4C-212ENST00000567828 RILPL2Q969X0 211 aa26.96■■□□□ 1.91
PPP4C-212ENST00000567828 CHMP4CQ96CF2 233 aa26.96■■□□□ 1.91
PPP4C-212ENST00000567828 TSPY2A6NKD2 308 aa26.95■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 SYN1P17600 705 aa26.95■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 SLC4A3P48751 1232 aa26.95■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa26.95■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 CHD1LQ86WJ1 897 aa26.95■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 CPXCR1Q8N123 301 aa26.95■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 ANAPC4Q9UJX5 808 aa26.95■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 FEM1BQ9UK73 627 aa26.95■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 RIPK3Q9Y572 518 aa26.95■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 SEPT4O43236 478 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 NMT2O60551 498 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 ZBED4O75132 1171 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 BMP3P12645 472 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 ALX1Q15699 326 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF792Q3KQV3 632 aa26.94■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 LAMA3Q16787 3333 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 NUCB1Q02818 461 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 IL17RBQ9NRM6 502 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 STX8Q9UNK0 236 aa26.93■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 DNM1LO00429 736 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 ATP2A1O14983 1001 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 FGAP02671 866 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 TINF2Q9BSI4 451 aa26.92■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 TMEM232C9JQI7 657 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 TICAM2Q86XR7 235 aa26.91■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 CCDC171Q6TFL3 1326 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 ORC4O43929 436 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 RASGRP2Q7LDG7 609 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 GMCL1Q96IK5 515 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 GDF15Q99988 308 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 TOMM22Q9NS69 142 aa26.9■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 MCCP23508 829 aa26.89■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 SLC1A4P43007 532 aa26.89■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 STAT2P52630 851 aa26.89■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 IKQ13123 557 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 ARRDC4Q8NCT1 418 aa26.89■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 DDX11Q96FC9 970 aa26.89■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.89■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
PPP4C-212ENST00000567828 ZMYM6O95789 1325 aa26.89■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 LTBP2Q14767 1821 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 KBTBD13C9JR72 458 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 HAND2P61296 217 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 MTMR7Q9Y216 660 aa26.88■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 LCTP09848 1927 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 FGRP09769 529 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 SDSP20132 328 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 KCTD1Q719H9 257 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 HOMER2Q9NSB8 354 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 NRBP1Q9UHY1 535 aa26.87■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa26.86■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 A0A1W2PPC1 479 aa26.86■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 OAZ1P54368 228 aa26.86■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 FAM160B2Q86V87 743 aa26.86■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 CHURC1Q8WUH1 139 aa26.86■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 STAG1Q8WVM7 1258 aa26.86■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 LRRC41Q15345 812 aa26.85■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 ANKRD35Q8N283 1001 aa26.85■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 FDX1P10109 184 aa26.84■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 RARBP10826 455 aa26.84■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 BMP8BP34820 402 aa26.84■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 NOVP48745 357 aa26.84■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 RTP1P59025 263 aa26.84■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 RCSD1Q6JBY9 416 aa26.84■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 CHST13Q8NET6 341 aa26.84■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa26.84■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 FBXO40Q9UH90 709 aa26.84■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 CNPY2Q9Y2B0 182 aa26.84■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 LRRC37A2A6NM11 1700 aa26.84■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 SNAP25P60880 206 aa26.83■■□□□ 1.89
PPP4C-212ENST00000567828 AGBL1Q96MI9 1066 aa26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms