RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.36□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 OXR1Q8N573 874 aa6.36□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.36□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 RNF32Q9H0A6 362 aa6.36□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 SP110Q9HB58 689 aa6.36□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.36□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM82A0PJX8 343 aa6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 CTSKP43235 329 aa6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 GJA8P48165 433 aa6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 PPP2R5EQ16537 467 aa6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 BBS9Q3SYG4 887 aa6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 BRF1Q92994 677 aa6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPATA32Q96LK8 384 aa6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 TINF2Q9BSI4 451 aa6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 GPR160Q9UJ42 338 aa6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 SHOXO15266 292 aa6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 PSPNO60542 156 aa6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 DUSP4Q13115 394 aa6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 KSR1Q8IVT5 923 aa6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 MYO15BQ96JP2 1530 aa6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1-209ENST00000498399 NACADO15069 1562 aa6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 FITM1A5D6W6 292 aa6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 GIPRP48546 466 aa6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 MESP2Q0VG99 397 aa6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 VPS37DQ86XT2 251 aa6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 USP35Q9P2H5 1018 aa6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 H0Y8X5 98 aa6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 EFEMP2O95967 443 aa6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF445P59923 1031 aa6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC14A2Q15849 920 aa6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 GNPTABQ3T906 1256 aa6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPPL2CQ8IUH8 684 aa6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 SHDQ96IW2 340 aa6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 MAP6Q96JE9 813 aa6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 GP6Q9HCN6 339 aa6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 A0A1W2PQH9 124 aa6.31□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 NOTOA8MTQ0 251 aa6.31□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 VAV1P15498 845 aa6.31□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 ARID5AQ03989 594 aa6.31□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 CHRNEQ04844 493 aa6.31□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 LILRA2Q8N149 483 aa6.31□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.31□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.31□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM84AQ96KN4 292 aa6.31□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC38A3Q99624 504 aa6.31□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.31□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF205O95201 554 aa6.3□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 CD247P20963 164 aa6.3□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 BMP8BP34820 402 aa6.3□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 KIR3DS1Q14943 382 aa6.3□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 NR0B2Q15466 257 aa6.3□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 PKN1Q16512 942 aa6.3□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.3□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 FIBCD1Q8N539 461 aa6.3□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 FGD4Q96M96 766 aa6.3□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.3□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 HAUS7Q99871 368 aa6.3□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.3□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.3□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 SCRIBQ14160 1630 aa6.29□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 CBFA2T2O43439 604 aa6.29□□□□□ -1.4
TIMMDC1-209ENST00000498399 GSNP06396 782 aa6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.3 ms