RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497842.6

TTC19-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, human

TSL 5

Gene TTC19, Length 1,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC19-208	ENST00000497842	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	VCAM1	P19320	739 aa		33.06	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		33.06	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		33.06	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		33.06	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		33.06	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	PLA2G6	O60733	806 aa		33.05	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	STAT2	P52630	851 aa		33.05	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	FAM160B2	Q86V87	743 aa		33.05	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	FEM1B	Q9UK73	627 aa		33.05	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		33.05	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	DTNB	O60941	627 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	PPFIA3	O75145	1194 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	SNAPC2	Q13487	334 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	DGKZ	Q13574	1117 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	WASF1	Q92558	559 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		33.04	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	DEXI	O95424	95 aa		33.03	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	SLC16A2	P36021	539 aa		33.03	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	GJA5	P36382	358 aa		33.03	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	GRM1	Q13255	1194 aa		33.03	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		33.03	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	33.03	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		33.03	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	CPVL	Q9H3G5	476 aa		33.03	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	CYTH3	O43739	400 aa		33.02	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		33.02	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		33.02	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	PDC	P20941	246 aa		33.01	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		33.01	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	SPRYD7	Q5W111	196 aa		33.01	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		33.01	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		33.01	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		33.01	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	PARP14	Q460N5	1801 aa		33.01	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	GTF2A2	P52657	109 aa		33	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	RGMB	Q6NW40	437 aa		33	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	SLC34A2	O95436	690 aa		32.99	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		32.99	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		32.99	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	USP17L15	C9J2P7	530 aa		32.98	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		32.98	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	USP17L11	C9JVI0	530 aa		32.98	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	USP17L18	D6R9N7	530 aa		32.98	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	USP17L22	D6RA61	530 aa		32.98	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		32.98	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	USP17L19	D6RCP7	530 aa		32.98	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	USP17L20	D6RJB6	530 aa		32.98	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	CETP	P11597	493 aa		32.98	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	USP17L24	Q0WX57	530 aa		32.98	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	FLOT1	O75955	427 aa		32.97	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		32.97	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	32.97	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	KIFC2	Q96AC6	838 aa		32.97	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		32.97	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		32.97	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	ALG1	Q9BT22	464 aa		32.97	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		32.97	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	HOMER1	Q86YM7	354 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	PIGS	Q96S52	555 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	SCG2	P13521	617 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	32.96	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	MTMR8	Q96EF0	704 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		32.96	■■■□□ 2.87
TTC19-208	ENST00000497842	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		32.95	■■■□□ 2.86
TTC19-208	ENST00000497842	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		32.95	■■■□□ 2.86
TTC19-208	ENST00000497842	PKN1	Q16512	942 aa		32.95	■■■□□ 2.86
TTC19-208	ENST00000497842	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.86
TTC19-208	ENST00000497842	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		32.95	■■■□□ 2.86
TTC19-208	ENST00000497842	CCDC102A	Q96A19	550 aa		32.95	■■■□□ 2.86
TTC19-208	ENST00000497842	RLF	Q13129	1914 aa		32.94	■■■□□ 2.86
TTC19-208	ENST00000497842	ZBTB5	O15062	677 aa		32.94	■■■□□ 2.86
TTC19-208	ENST00000497842	XBP1	P17861	261 aa		32.94	■■■□□ 2.86
TTC19-208	ENST00000497842	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
TTC19-208	ENST00000497842	TRIM29	Q14134	588 aa		32.94	■■■□□ 2.86
TTC19-208	ENST00000497842	TREML2	Q5T2D2	321 aa		32.94	■■■□□ 2.86
TTC19-208	ENST00000497842	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		32.94	■■■□□ 2.86
TTC19-208	ENST00000497842	C8orf76	Q96K31	380 aa		32.94	■■■□□ 2.86
TTC19-208	ENST00000497842	TSKS	Q9UJT2	592 aa		32.94	■■■□□ 2.86
TTC19-208	ENST00000497842	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		32.94	■■■□□ 2.86
TTC19-208	ENST00000497842	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86

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