RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FEM1BQ9UK73 627 aa31.14■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa31.14■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EVI5LQ96CN4 794 aa31.13■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRCH3Q96II8 777 aa31.13■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LAMA3Q16787 3333 aa31.13■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP2A1O14983 1001 aa31.12■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TDHQ8IZJ6 230 aa31.12■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CPXCR1Q8N123 301 aa31.12■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIPK3Q9Y572 518 aa31.12■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC4A3P48751 1232 aa31.11■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDE1AP54750 535 aa31.11■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLFN13Q68D06 897 aa31.11■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDX11Q96FC9 970 aa31.11■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXP2O15409 715 aa31.1■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RTP1P59025 263 aa31.1■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC41Q15345 812 aa31.1■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa31.1■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RARBP10826 455 aa31.09■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BMP3P12645 472 aa31.09■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa31.09■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP31.09■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTDSPL2Q05D32 466 aa31.08■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa31.08■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa31.08■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa31.08■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNPY2Q9Y2B0 182 aa31.08■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa31.08■■■□□ 2.57
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADCYAP1R1P41586 468 aa31.07■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRIT3Q3SXY7 679 aa31.07■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HELLSQ9NRZ9 838 aa31.07■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa31.06■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSPY2A6NKD2 308 aa31.06■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OAZ1P54368 228 aa31.06■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AAMPQ13685 434 aa31.06■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VPS53Q5VIR6 699 aa31.06■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXO40Q9UH90 709 aa31.06■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMCHD1A6NHR9 2005 aa31.06■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM232C9JQI7 657 aa31.05■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FDX1P10109 184 aa31.05■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AKR1A1P14550 325 aa31.05■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FERMT2Q96AC1 680 aa31.05■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GMCL1Q96IK5 515 aa31.05■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INCENPQ9NQS7 918 aa31.05■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANAPC4Q9UJX5 808 aa31.05■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STX8Q9UNK0 236 aa31.05■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa31.04■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STAT2P52630 851 aa31.04■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP31.04■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF180Q86T96 592 aa31.04■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD35Q8N283 1001 aa31.04■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHST13Q8NET6 341 aa31.04■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHURC1Q8WUH1 139 aa31.04■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PGK1P00558 417 aa31.03■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC1A4P43007 532 aa31.03■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IKQ13123 557 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNX17Q15036 470 aa31.03■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALX1Q15699 326 aa31.03■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR153Q6NV75 609 aa31.03■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa31.03■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM160B2Q86V87 743 aa31.03■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LNPKQ9C0E8 428 aa31.03■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHF24Q9UPV7 400 aa31.03■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCCP23508 829 aa31.02■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM60Q495X7 471 aa31.02■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TICAM2Q86XR7 235 aa31.02■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STAG1Q8WVM7 1258 aa31.02■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHMP4CQ96CF2 233 aa31.02■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM227BQ96M60 508 aa31.02■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL17RBQ9NRM6 502 aa31.02■■■□□ 2.56
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa31.01■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM184BQ9ULE4 1060 aa31.01■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0D9SFI3 127 aa31■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ORC4O43929 436 aa31■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NMT2O60551 498 aa31■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1orf53Q5VUE5 145 aa31■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOMER2Q9NSB8 354 aa31■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TACC3Q9Y6A5 838 aa31■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa30.99■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RCSD1Q6JBY9 416 aa30.99■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLA2G6O60733 806 aa30.98■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGAP02671 866 aa30.98■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCTD1Q719H9 257 aa30.98■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMC5Q8IY18 1101 aa30.98■■■□□ 2.55
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOMM22Q9NS69 142 aa30.98■■■□□ 2.55
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