RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439830.5

ANKRD28-203, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 5

Gene ANKRD28, Length 592 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-203ENST00000439830 FAM47AQ5JRC9 791 aa29.97■■■□□ 2.39
ANKRD28-203ENST00000439830 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
ANKRD28-203ENST00000439830 KIFC2Q96AC6 838 aa29.97■■■□□ 2.39
ANKRD28-203ENST00000439830 FEM1BQ9UK73 627 aa29.97■■■□□ 2.39
ANKRD28-203ENST00000439830 LTBP2Q14767 1821 aa29.96■■■□□ 2.39
ANKRD28-203ENST00000439830 KBTBD13C9JR72 458 aa29.96■■■□□ 2.39
ANKRD28-203ENST00000439830 ZBED4O75132 1171 aa29.96■■■□□ 2.39
ANKRD28-203ENST00000439830 TINF2Q9BSI4 451 aa29.96■■■□□ 2.39
ANKRD28-203ENST00000439830 ATP2A1O14983 1001 aa29.95■■■□□ 2.39
ANKRD28-203ENST00000439830 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa29.95■■■□□ 2.39
ANKRD28-203ENST00000439830 SLFN13Q68D06 897 aa29.95■■■□□ 2.39
ANKRD28-203ENST00000439830 CPXCR1Q8N123 301 aa29.95■■■□□ 2.39
ANKRD28-203ENST00000439830 HELLSQ9NRZ9 838 aa29.95■■■□□ 2.39
ANKRD28-203ENST00000439830 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP29.95■■■□□ 2.39
ANKRD28-203ENST00000439830 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa29.94■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 RIPK3Q9Y572 518 aa29.94■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 TSPY2A6NKD2 308 aa29.93■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 BMP3P12645 472 aa29.93■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 CTDSPL2Q05D32 466 aa29.93■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 VPS53Q5VIR6 699 aa29.93■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 LNPKQ9C0E8 428 aa29.93■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 SLC4A3P48751 1232 aa29.92■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 TICAM2Q86XR7 235 aa29.92■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 DDX11Q96FC9 970 aa29.92■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 RARBP10826 455 aa29.91■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 OAZ1P54368 228 aa29.91■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 ANAPC4Q9UJX5 808 aa29.91■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 STX8Q9UNK0 236 aa29.91■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 CNPY2Q9Y2B0 182 aa29.91■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 LAMA4Q16363 1823 aa29.91■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 STAT2P52630 851 aa29.9■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 LRRC41Q15345 812 aa29.9■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 SMC5Q8IY18 1101 aa29.9■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 TDHQ8IZJ6 230 aa29.9■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 GMCL1Q96IK5 515 aa29.9■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 FAM227BQ96M60 508 aa29.9■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 FBXO40Q9UH90 709 aa29.9■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa29.89■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 A0A0D9SFI3 127 aa29.89■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 FDX1P10109 184 aa29.89■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 SLC1A4P43007 532 aa29.89■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 RTP1P59025 263 aa29.89■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 ALX1Q15699 326 aa29.89■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa29.89■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP29.89■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa29.89■■■□□ 2.38
ANKRD28-203ENST00000439830 TMEM232C9JQI7 657 aa29.88■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 AKR1A1P14550 325 aa29.88■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 FAM160B2Q86V87 743 aa29.88■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 CHST13Q8NET6 341 aa29.88■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 LRCH3Q96II8 777 aa29.88■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 INCENPQ9NQS7 918 aa29.88■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa29.88■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa29.87■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 ORC4O43929 436 aa29.87■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 IKQ13123 557 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa29.87■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 CHURC1Q8WUH1 139 aa29.87■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 IL17RBQ9NRM6 502 aa29.87■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa29.87■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa29.87■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 NMT2O60551 498 aa29.86■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa29.86■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 ANKRD35Q8N283 1001 aa29.86■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 ZMYM6O95789 1325 aa29.86■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 MCCP23508 829 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 ADCYAP1R1P41586 468 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 SNX17Q15036 470 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 RNF180Q86T96 592 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 STAG1Q8WVM7 1258 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 TACC3Q9Y6A5 838 aa29.85■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 FGAP02671 866 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 FGRP09769 529 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 LRIT3Q3SXY7 679 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 RILPL2Q969X0 211 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 FERMT2Q96AC1 680 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 CHMP4CQ96CF2 233 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 TOMM22Q9NS69 142 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 HOMER2Q9NSB8 354 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 PHF24Q9UPV7 400 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 CCDC171Q6TFL3 1326 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 LRRC37A2A6NM11 1700 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 PLA2G6O60733 806 aa29.83■■■□□ 2.37
ANKRD28-203ENST00000439830 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms