RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389416.8

PTPRN2-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-202ENST00000389416 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 MLXIPQ9HAP2 919 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 DNAI1Q9UI46 699 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 PCDHA4Q9UN74 947 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 UTYO14607 1347 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 EPB41P11171 864 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 CDC25AP30304 524 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 SLC39A14Q15043 492 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 TBCKQ8TEA7 893 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 FNBP1Q96RU3 617 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 FANCCQ00597 558 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 TTC14Q96N46 770 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 MXD3Q9BW11 206 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 MMP1P03956 469 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 ZNF445P59923 1031 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 GPBP1Q86WP2 473 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 CEP95Q96GE4 821 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-202ENST00000389416 NEFHP12036 1026 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 CTNNA2P26232 953 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 USP14P54578 494 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 MCTP2Q6DN12 878 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 TAB2Q9NYJ8 693 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 RGS22Q8NE09 1264 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 CSRNP2Q9H175 543 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 ALX1Q15699 326 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 RDH13Q8NBN7 331 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 GPT2Q8TD30 523 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 EEF2KMTQ96G04 330 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 USP17L5A8MUK1 530 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 UBE2SQ16763 222 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 NELFBQ8WX92 580 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 EXOC3O60645 756 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 CCDC175P0C221 793 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 STRN3Q13033 797 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 STK24Q9Y6E0 443 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 KRBA2Q6ZNG9 492 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 KIF5AQ12840 1032 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 KCTD2Q14681 263 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 WRNIP1Q96S55 665 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 ABCC12Q96J65 1359 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 KLRK1P26718 216 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 SLFN12Q8IYM2 578 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 CA8P35219 290 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 DPEP1P16444 411 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 XKR9Q5GH70 373 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 CNGA4Q8IV77 575 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 LINC00301Q8NCQ3 95 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 CCDC102AQ96A19 550 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.075e-6■■■■■ 30.6
PTPRN2-202ENST00000389416 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 ANKRD62A6NC57 917 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 TRAPPC10P48553 1259 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 LY9Q9HBG7 655 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 KIAA1024Q9UPX6 916 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 RFX7Q2KHR2 1363 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 SPDYE4A6NLX3 237 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRN2-202ENST00000389416 LRCH2Q5VUJ6 765 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms