RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021424.4

Sptlc2-201, Transcript of Serine palmitoyltransferase 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sptlc2, Length 6,710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Wdr93Q402B2 695 aa16.78■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ccdc124Q9D8X2 217 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Fhod3Q76LL6 1578 aa16.78■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Unc13aQ4KUS2 1712 aa16.78■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Armcx3Q8BHS6 379 aa16.78■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Nlrp5Q9R1M5 1163 aa16.78■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Atf7ipQ7TT18 1306 aa16.78■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Lbhd1A0A087WPA0 259 aa16.78■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ctnna1P26231 906 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ccdc125Q5U465 500 aa16.78■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rhpn1Q61085 643 aa16.78■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Sh2b1Q91ZM2 756 aa16.78■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Xab2Q9DCD2 855 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Slx4Q6P1D7 1565 aa16.77■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Nlrp1bA1Z198 1177 aa16.77■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 MmeQ61391 750 aa16.77■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gbp5Q8CFB4 590 aa16.77■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Dnajc17Q91WT4 303 aa16.77■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rbm43Q99J64 343 aa16.77■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Dach1Q9QYB2 751 aa16.77■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa16.77■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Il15P48346 162 aa16.77■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Rimbp2Q80U40 1072 aa16.77■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Caprin1Q60865 707 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gimap7Q8R379 293 aa16.77■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ola1Q9CZ30 396 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 SarnpQ9D1J3 210 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Serpinb12Q9D7P9 423 aa16.77■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Q9DAQ4 598 aa16.77■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Adarb2Q9JI20 745 aa16.77■□□□□ 0.28
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 EsrrbQ61539 433 aa16.77■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Atp6v0a4Q920R6 833 aa16.77■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Syde2E9PUP1 1314 aa16.77■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Pde11aP0C1Q2 933 aa16.77■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Synpo2Q91YE8 1087 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Krt90E9Q1Z0 538 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Vmn2r68L7N2B3 851 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Trappc10Q3TLI0 1259 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Dhx58Q99J87 678 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm45015A0A140LII9 184 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Pank4Q80YV4 820 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm45194A0A140LJG2 572 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Arhgap4B1AUY3 965 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Stk10O55098 966 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cnga4Q3UW12 575 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tmod3Q9JHJ0 352 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 IdeQ9JHR7 1019 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gbp6A0A0G2JDV3 611 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cnbd1B1AWM0 430 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm43302L7N1X8 611 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 PhbP67778 272 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Fam178bQ24JP3 464 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Apol10aQ8CCA5 318 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cyp27a1Q9DBG1 533 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ppp1r12aQ9DBR7 1029 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Veph1A1A535 833 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Snap25P60879 206 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cdr2P97817 455 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cyp2c67Q569X9 491 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Jade1Q6ZPI0 834 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Akap7Q7TN79 314 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Sgk1Q9WVC6 431 aa16.76■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Wdr36Q3TAQ9 899 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ccdc70Q9D9B0 223 aa16.75■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Pex3Q9QXY9 372 aa16.75■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Gm6583E9Q8Z1 469 aa16.75■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tfap4Q9JIZ5 338 aa16.75■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Irx4Q9QY61 515 aa16.75■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ftl2P49945 183 aa16.75■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Mybpc2Q5XKE0 1136 aa16.75■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Pim2Q62070 370 aa16.75■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 CcnyQ8BGU5 341 aa16.75■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Inpp5fQ8CDA1 1132 aa16.75■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ccdc153P0C7Q1 202 aa16.75■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Sesn2P58043 480 aa16.75■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 YwhagP61982 247 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa16.75■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Golga5Q9QYE6 729 aa16.75■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ccdc160Q3UYG1 323 aa16.75■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Arhgap18Q8K0Q5 663 aa16.75■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Pcdhb12Q91Y07 789 aa16.75■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Trpd52l3Q9CQ14 231 aa16.75■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Heatr4E9Q357 955 aa16.74■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 CopeO89079 308 aa16.74■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Cd72P21855 354 aa16.74■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Sstr3P30935 428 aa16.74■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Dynlt1P51807 113 aa16.74■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Sept10Q8C650 452 aa16.74■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Kbtbd12Q9D618 625 aa16.74■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Il7P10168 154 aa16.74■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Retreg2Q6NS82 541 aa16.74■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tmem132aQ922P8 1018 aa16.74■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Ppfia2Q8BSS9 1257 aa16.74■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Tmem191cQ9JJB1 302 aa16.74■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Prex2Q3LAC4 1598 aa16.74■□□□□ 0.27
Sptlc2-201ENSMUST00000021424 Atp11aP98197 1187 aa16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 94.9 ms