Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Ppfia2Q8BSS9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ppfia2Q8BSS9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ppfia2Q8BSS9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ppfia2Q8BSS9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ppfia2Q8BSS9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ppfia2Q8BSS9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Ppfia2Q8BSS9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Ppfia2Q8BSS9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ppfia2Q8BSS9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Ppfia2Q8BSS9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ppfia2Q8BSS9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ppfia2Q8BSS9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Ppfia2Q8BSS9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ppfia2Q8BSS9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ppfia2Q8BSS9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ppfia2Q8BSS9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ppfia2Q8BSS9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Ppfia2Q8BSS9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Ppfia2Q8BSS9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Ppfia2Q8BSS9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ppfia2Q8BSS9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ppfia2Q8BSS9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ppfia2Q8BSS9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ppfia2Q8BSS9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ppfia2Q8BSS9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ppfia2Q8BSS9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ppfia2Q8BSS9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Ppfia2Q8BSS9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ppfia2Q8BSS9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ppfia2Q8BSS9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ppfia2Q8BSS9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ppfia2Q8BSS9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ppfia2Q8BSS9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Ppfia2Q8BSS9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ppfia2Q8BSS9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ppfia2Q8BSS9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ppfia2Q8BSS9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ppfia2Q8BSS9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ppfia2Q8BSS9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ppfia2Q8BSS9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ppfia2Q8BSS9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ppfia2Q8BSS9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ppfia2Q8BSS9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ppfia2Q8BSS9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Ppfia2Q8BSS9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ppfia2Q8BSS9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ppfia2Q8BSS9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ppfia2Q8BSS9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ppfia2Q8BSS9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ppfia2Q8BSS9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ppfia2Q8BSS9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Ppfia2Q8BSS9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Ppfia2Q8BSS9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ppfia2Q8BSS9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ppfia2Q8BSS9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ppfia2Q8BSS9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ppfia2Q8BSS9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ppfia2Q8BSS9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Ppfia2Q8BSS9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ppfia2Q8BSS9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ppfia2Q8BSS9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ppfia2Q8BSS9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ppfia2Q8BSS9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ppfia2Q8BSS9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ppfia2Q8BSS9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ppfia2Q8BSS9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Ppfia2Q8BSS9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ppfia2Q8BSS9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ppfia2Q8BSS9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ppfia2Q8BSS9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ppfia2Q8BSS9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ppfia2Q8BSS9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ppfia2Q8BSS9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ppfia2Q8BSS9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ppfia2Q8BSS9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ppfia2Q8BSS9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ppfia2Q8BSS9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ppfia2Q8BSS9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppfia2Q8BSS9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppfia2Q8BSS9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ppfia2Q8BSS9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppfia2Q8BSS9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppfia2Q8BSS9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ppfia2Q8BSS9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppfia2Q8BSS9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ppfia2Q8BSS9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ppfia2Q8BSS9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ppfia2Q8BSS9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ppfia2Q8BSS9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ppfia2Q8BSS9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppfia2Q8BSS9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ppfia2Q8BSS9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ppfia2Q8BSS9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppfia2Q8BSS9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ppfia2Q8BSS9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ppfia2Q8BSS9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ppfia2Q8BSS9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppfia2Q8BSS9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppfia2Q8BSS9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms