Protein–RNA interactions for Protein: Q91WT4

Dnajc17, DnaJ homolog subfamily C member 17, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc17Q91WT4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC44.38■■■■■ 4.7
Dnajc17Q91WT4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Dnajc17Q91WT4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Dnajc17Q91WT4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
Dnajc17Q91WT4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
Dnajc17Q91WT4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Dnajc17Q91WT4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Dnajc17Q91WT4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Dnajc17Q91WT4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Dnajc17Q91WT4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Dnajc17Q91WT4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Dnajc17Q91WT4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Dnajc17Q91WT4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Dnajc17Q91WT4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Dnajc17Q91WT4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Dnajc17Q91WT4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Dnajc17Q91WT4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Dnajc17Q91WT4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Dnajc17Q91WT4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Dnajc17Q91WT4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Dnajc17Q91WT4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Dnajc17Q91WT4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Dnajc17Q91WT4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Dnajc17Q91WT4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Dnajc17Q91WT4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Dnajc17Q91WT4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Dnajc17Q91WT4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Dnajc17Q91WT4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Dnajc17Q91WT4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Dnajc17Q91WT4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Dnajc17Q91WT4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Dnajc17Q91WT4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Dnajc17Q91WT4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Dnajc17Q91WT4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Dnajc17Q91WT4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Dnajc17Q91WT4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Dnajc17Q91WT4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Dnajc17Q91WT4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Dnajc17Q91WT4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Dnajc17Q91WT4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Dnajc17Q91WT4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Dnajc17Q91WT4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Dnajc17Q91WT4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Dnajc17Q91WT4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Dnajc17Q91WT4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Dnajc17Q91WT4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Dnajc17Q91WT4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Dnajc17Q91WT4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Dnajc17Q91WT4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Dnajc17Q91WT4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Dnajc17Q91WT4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Dnajc17Q91WT4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Dnajc17Q91WT4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Dnajc17Q91WT4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Dnajc17Q91WT4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Dnajc17Q91WT4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Dnajc17Q91WT4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Dnajc17Q91WT4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Dnajc17Q91WT4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Dnajc17Q91WT4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Dnajc17Q91WT4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Dnajc17Q91WT4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Dnajc17Q91WT4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Dnajc17Q91WT4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Dnajc17Q91WT4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Dnajc17Q91WT4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Dnajc17Q91WT4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Dnajc17Q91WT4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Dnajc17Q91WT4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Dnajc17Q91WT4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Dnajc17Q91WT4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Dnajc17Q91WT4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Dnajc17Q91WT4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Dnajc17Q91WT4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Dnajc17Q91WT4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Dnajc17Q91WT4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Dnajc17Q91WT4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Dnajc17Q91WT4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Dnajc17Q91WT4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Dnajc17Q91WT4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Dnajc17Q91WT4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Dnajc17Q91WT4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Dnajc17Q91WT4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Dnajc17Q91WT4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Dnajc17Q91WT4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Dnajc17Q91WT4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Dnajc17Q91WT4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Dnajc17Q91WT4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Dnajc17Q91WT4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Dnajc17Q91WT4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Dnajc17Q91WT4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Dnajc17Q91WT4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Dnajc17Q91WT4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Dnajc17Q91WT4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Dnajc17Q91WT4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Dnajc17Q91WT4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Dnajc17Q91WT4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Dnajc17Q91WT4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Dnajc17Q91WT4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Dnajc17Q91WT4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms