Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
Tmod3Q9JHJ0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Tmod3Q9JHJ0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Tmod3Q9JHJ0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
Tmod3Q9JHJ0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Tmod3Q9JHJ0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Tmod3Q9JHJ0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Tmod3Q9JHJ0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Tmod3Q9JHJ0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Tmod3Q9JHJ0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Tmod3Q9JHJ0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Tmod3Q9JHJ0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
Tmod3Q9JHJ0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Tmod3Q9JHJ0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Tmod3Q9JHJ0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Tmod3Q9JHJ0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Tmod3Q9JHJ0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Tmod3Q9JHJ0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Tmod3Q9JHJ0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Tmod3Q9JHJ0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Tmod3Q9JHJ0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Tmod3Q9JHJ0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Tmod3Q9JHJ0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Tmod3Q9JHJ0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Tmod3Q9JHJ0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Tmod3Q9JHJ0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Tmod3Q9JHJ0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Tmod3Q9JHJ0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Tmod3Q9JHJ0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Tmod3Q9JHJ0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Tmod3Q9JHJ0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Tmod3Q9JHJ0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Tmod3Q9JHJ0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Tmod3Q9JHJ0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Tmod3Q9JHJ0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Tmod3Q9JHJ0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Tmod3Q9JHJ0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Tmod3Q9JHJ0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Tmod3Q9JHJ0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Tmod3Q9JHJ0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Tmod3Q9JHJ0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Tmod3Q9JHJ0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Tmod3Q9JHJ0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Tmod3Q9JHJ0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Tmod3Q9JHJ0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Tmod3Q9JHJ0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Tmod3Q9JHJ0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Tmod3Q9JHJ0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Tmod3Q9JHJ0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Tmod3Q9JHJ0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Tmod3Q9JHJ0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Tmod3Q9JHJ0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Tmod3Q9JHJ0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tmod3Q9JHJ0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tmod3Q9JHJ0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Tmod3Q9JHJ0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Tmod3Q9JHJ0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Tmod3Q9JHJ0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Tmod3Q9JHJ0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Tmod3Q9JHJ0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Tmod3Q9JHJ0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Tmod3Q9JHJ0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Tmod3Q9JHJ0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Tmod3Q9JHJ0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Tmod3Q9JHJ0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Tmod3Q9JHJ0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Tmod3Q9JHJ0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Tmod3Q9JHJ0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Tmod3Q9JHJ0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Tmod3Q9JHJ0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Tmod3Q9JHJ0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Tmod3Q9JHJ0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Tmod3Q9JHJ0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Tmod3Q9JHJ0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Tmod3Q9JHJ0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Tmod3Q9JHJ0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Tmod3Q9JHJ0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Tmod3Q9JHJ0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Tmod3Q9JHJ0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Tmod3Q9JHJ0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Tmod3Q9JHJ0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Tmod3Q9JHJ0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Tmod3Q9JHJ0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Tmod3Q9JHJ0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Tmod3Q9JHJ0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Tmod3Q9JHJ0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Tmod3Q9JHJ0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Tmod3Q9JHJ0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Tmod3Q9JHJ0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Tmod3Q9JHJ0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Tmod3Q9JHJ0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Tmod3Q9JHJ0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Tmod3Q9JHJ0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Tmod3Q9JHJ0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Tmod3Q9JHJ0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Tmod3Q9JHJ0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Tmod3Q9JHJ0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Tmod3Q9JHJ0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Tmod3Q9JHJ0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Tmod3Q9JHJ0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
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